Protein–RNA interactions for Protein: Q86X40

LRRC28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC28Q86X40 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC28Q86X40 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC28Q86X40 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC28Q86X40 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC28Q86X40 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC28Q86X40 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC28Q86X40 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC28Q86X40 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC28Q86X40 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC28Q86X40 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC28Q86X40 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LRRC28Q86X40 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC28Q86X40 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC28Q86X40 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC28Q86X40 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC28Q86X40 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC28Q86X40 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC28Q86X40 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC28Q86X40 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC28Q86X40 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC28Q86X40 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC28Q86X40 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC28Q86X40 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC28Q86X40 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC28Q86X40 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC28Q86X40 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC28Q86X40 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC28Q86X40 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC28Q86X40 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC28Q86X40 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC28Q86X40 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC28Q86X40 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC28Q86X40 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC28Q86X40 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC28Q86X40 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC28Q86X40 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC28Q86X40 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC28Q86X40 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC28Q86X40 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC28Q86X40 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC28Q86X40 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC28Q86X40 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC28Q86X40 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC28Q86X40 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC28Q86X40 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC28Q86X40 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC28Q86X40 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC28Q86X40 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC28Q86X40 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC28Q86X40 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC28Q86X40 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC28Q86X40 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC28Q86X40 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC28Q86X40 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC28Q86X40 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC28Q86X40 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC28Q86X40 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC28Q86X40 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC28Q86X40 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC28Q86X40 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC28Q86X40 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC28Q86X40 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC28Q86X40 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC28Q86X40 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC28Q86X40 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC28Q86X40 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC28Q86X40 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC28Q86X40 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC28Q86X40 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC28Q86X40 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC28Q86X40 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC28Q86X40 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC28Q86X40 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC28Q86X40 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
LRRC28Q86X40 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRRC28Q86X40 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC28Q86X40 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC28Q86X40 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC28Q86X40 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC28Q86X40 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC28Q86X40 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC28Q86X40 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC28Q86X40 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC28Q86X40 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC28Q86X40 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC28Q86X40 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC28Q86X40 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC28Q86X40 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRRC28Q86X40 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC28Q86X40 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC28Q86X40 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC28Q86X40 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC28Q86X40 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC28Q86X40 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC28Q86X40 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC28Q86X40 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC28Q86X40 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC28Q86X40 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC28Q86X40 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC28Q86X40 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms