Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW6

N4BP2, NEDD4-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP2Q86UW6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
N4BP2Q86UW6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC36.11■■■■□ 3.37
N4BP2Q86UW6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
N4BP2Q86UW6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
N4BP2Q86UW6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
N4BP2Q86UW6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
N4BP2Q86UW6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
N4BP2Q86UW6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
N4BP2Q86UW6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
N4BP2Q86UW6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
N4BP2Q86UW6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
N4BP2Q86UW6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
N4BP2Q86UW6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
N4BP2Q86UW6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
N4BP2Q86UW6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
N4BP2Q86UW6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
N4BP2Q86UW6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
N4BP2Q86UW6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
N4BP2Q86UW6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
N4BP2Q86UW6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
N4BP2Q86UW6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
N4BP2Q86UW6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
N4BP2Q86UW6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
N4BP2Q86UW6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
N4BP2Q86UW6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
N4BP2Q86UW6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
N4BP2Q86UW6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
N4BP2Q86UW6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
N4BP2Q86UW6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
N4BP2Q86UW6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
N4BP2Q86UW6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.31
N4BP2Q86UW6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
N4BP2Q86UW6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
N4BP2Q86UW6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
N4BP2Q86UW6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
N4BP2Q86UW6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
N4BP2Q86UW6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
N4BP2Q86UW6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
N4BP2Q86UW6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
N4BP2Q86UW6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
N4BP2Q86UW6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
N4BP2Q86UW6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC35.65■■■■□ 3.3
N4BP2Q86UW6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
N4BP2Q86UW6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
N4BP2Q86UW6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
N4BP2Q86UW6 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
N4BP2Q86UW6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
N4BP2Q86UW6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
N4BP2Q86UW6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
N4BP2Q86UW6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
N4BP2Q86UW6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
N4BP2Q86UW6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
N4BP2Q86UW6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
N4BP2Q86UW6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
N4BP2Q86UW6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
N4BP2Q86UW6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
N4BP2Q86UW6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
N4BP2Q86UW6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
N4BP2Q86UW6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
N4BP2Q86UW6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
N4BP2Q86UW6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.28
N4BP2Q86UW6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
N4BP2Q86UW6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
N4BP2Q86UW6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
N4BP2Q86UW6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
N4BP2Q86UW6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
N4BP2Q86UW6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
N4BP2Q86UW6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
N4BP2Q86UW6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
N4BP2Q86UW6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
N4BP2Q86UW6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
N4BP2Q86UW6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
N4BP2Q86UW6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
N4BP2Q86UW6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
N4BP2Q86UW6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
N4BP2Q86UW6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
N4BP2Q86UW6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
N4BP2Q86UW6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
N4BP2Q86UW6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.26
N4BP2Q86UW6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
N4BP2Q86UW6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
N4BP2Q86UW6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
N4BP2Q86UW6 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
N4BP2Q86UW6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
N4BP2Q86UW6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
N4BP2Q86UW6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
N4BP2Q86UW6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
N4BP2Q86UW6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
N4BP2Q86UW6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
N4BP2Q86UW6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
N4BP2Q86UW6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
N4BP2Q86UW6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
N4BP2Q86UW6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
N4BP2Q86UW6 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
N4BP2Q86UW6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
N4BP2Q86UW6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
N4BP2Q86UW6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
N4BP2Q86UW6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
N4BP2Q86UW6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
N4BP2Q86UW6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms