Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7G1

CLNK, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNKQ7Z7G1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLNKQ7Z7G1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CLNKQ7Z7G1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CLNKQ7Z7G1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CLNKQ7Z7G1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CLNKQ7Z7G1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
CLNKQ7Z7G1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CLNKQ7Z7G1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLNKQ7Z7G1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLNKQ7Z7G1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLNKQ7Z7G1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLNKQ7Z7G1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLNKQ7Z7G1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLNKQ7Z7G1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLNKQ7Z7G1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLNKQ7Z7G1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLNKQ7Z7G1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLNKQ7Z7G1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
CLNKQ7Z7G1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CLNKQ7Z7G1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLNKQ7Z7G1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLNKQ7Z7G1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLNKQ7Z7G1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLNKQ7Z7G1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLNKQ7Z7G1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLNKQ7Z7G1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLNKQ7Z7G1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLNKQ7Z7G1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLNKQ7Z7G1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLNKQ7Z7G1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLNKQ7Z7G1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLNKQ7Z7G1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLNKQ7Z7G1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLNKQ7Z7G1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLNKQ7Z7G1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLNKQ7Z7G1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLNKQ7Z7G1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLNKQ7Z7G1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLNKQ7Z7G1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLNKQ7Z7G1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLNKQ7Z7G1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLNKQ7Z7G1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLNKQ7Z7G1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLNKQ7Z7G1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CLNKQ7Z7G1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLNKQ7Z7G1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLNKQ7Z7G1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLNKQ7Z7G1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLNKQ7Z7G1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLNKQ7Z7G1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLNKQ7Z7G1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLNKQ7Z7G1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLNKQ7Z7G1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLNKQ7Z7G1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLNKQ7Z7G1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLNKQ7Z7G1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLNKQ7Z7G1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLNKQ7Z7G1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLNKQ7Z7G1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLNKQ7Z7G1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLNKQ7Z7G1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLNKQ7Z7G1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLNKQ7Z7G1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLNKQ7Z7G1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLNKQ7Z7G1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLNKQ7Z7G1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLNKQ7Z7G1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLNKQ7Z7G1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLNKQ7Z7G1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLNKQ7Z7G1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLNKQ7Z7G1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLNKQ7Z7G1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLNKQ7Z7G1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLNKQ7Z7G1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLNKQ7Z7G1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLNKQ7Z7G1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLNKQ7Z7G1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLNKQ7Z7G1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CLNKQ7Z7G1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CLNKQ7Z7G1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLNKQ7Z7G1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CLNKQ7Z7G1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLNKQ7Z7G1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLNKQ7Z7G1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLNKQ7Z7G1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
CLNKQ7Z7G1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLNKQ7Z7G1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLNKQ7Z7G1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLNKQ7Z7G1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLNKQ7Z7G1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLNKQ7Z7G1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLNKQ7Z7G1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLNKQ7Z7G1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLNKQ7Z7G1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLNKQ7Z7G1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLNKQ7Z7G1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLNKQ7Z7G1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLNKQ7Z7G1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLNKQ7Z7G1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLNKQ7Z7G1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms