Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT4

SSX8, Protein SSX8, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX8Q7RTT4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SSX8Q7RTT4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SSX8Q7RTT4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSX8Q7RTT4 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSX8Q7RTT4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSX8Q7RTT4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SSX8Q7RTT4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSX8Q7RTT4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSX8Q7RTT4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSX8Q7RTT4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSX8Q7RTT4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SSX8Q7RTT4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSX8Q7RTT4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSX8Q7RTT4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSX8Q7RTT4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SSX8Q7RTT4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SSX8Q7RTT4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSX8Q7RTT4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSX8Q7RTT4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSX8Q7RTT4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSX8Q7RTT4 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSX8Q7RTT4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSX8Q7RTT4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSX8Q7RTT4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SSX8Q7RTT4 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSX8Q7RTT4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSX8Q7RTT4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSX8Q7RTT4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSX8Q7RTT4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSX8Q7RTT4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSX8Q7RTT4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SSX8Q7RTT4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SSX8Q7RTT4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SSX8Q7RTT4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSX8Q7RTT4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SSX8Q7RTT4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SSX8Q7RTT4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSX8Q7RTT4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSX8Q7RTT4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SSX8Q7RTT4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SSX8Q7RTT4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SSX8Q7RTT4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SSX8Q7RTT4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SSX8Q7RTT4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SSX8Q7RTT4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SSX8Q7RTT4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SSX8Q7RTT4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SSX8Q7RTT4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SSX8Q7RTT4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SSX8Q7RTT4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SSX8Q7RTT4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SSX8Q7RTT4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SSX8Q7RTT4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SSX8Q7RTT4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SSX8Q7RTT4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SSX8Q7RTT4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SSX8Q7RTT4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SSX8Q7RTT4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SSX8Q7RTT4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SSX8Q7RTT4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SSX8Q7RTT4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SSX8Q7RTT4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SSX8Q7RTT4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SSX8Q7RTT4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SSX8Q7RTT4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SSX8Q7RTT4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SSX8Q7RTT4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SSX8Q7RTT4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SSX8Q7RTT4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SSX8Q7RTT4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SSX8Q7RTT4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSX8Q7RTT4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSX8Q7RTT4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SSX8Q7RTT4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SSX8Q7RTT4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SSX8Q7RTT4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SSX8Q7RTT4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSX8Q7RTT4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSX8Q7RTT4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSX8Q7RTT4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSX8Q7RTT4 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSX8Q7RTT4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSX8Q7RTT4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSX8Q7RTT4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSX8Q7RTT4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSX8Q7RTT4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSX8Q7RTT4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSX8Q7RTT4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSX8Q7RTT4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSX8Q7RTT4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSX8Q7RTT4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSX8Q7RTT4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSX8Q7RTT4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SSX8Q7RTT4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SSX8Q7RTT4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SSX8Q7RTT4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SSX8Q7RTT4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSX8Q7RTT4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SSX8Q7RTT4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSX8Q7RTT4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.3 ms