Protein–RNA interactions for Protein: Q7KZ85

SUPT6H, Transcription elongation factor SPT6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPT6HQ7KZ85 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC43.48■■■■■ 4.55
SUPT6HQ7KZ85 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
SUPT6HQ7KZ85 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
SUPT6HQ7KZ85 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
SUPT6HQ7KZ85 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC43.45■■■■■ 4.55
SUPT6HQ7KZ85 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
SUPT6HQ7KZ85 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.53
SUPT6HQ7KZ85 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
SUPT6HQ7KZ85 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
SUPT6HQ7KZ85 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.34■■■■■ 4.53
SUPT6HQ7KZ85 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.32■■■■■ 4.53
SUPT6HQ7KZ85 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
SUPT6HQ7KZ85 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC43.28■■■■■ 4.52
SUPT6HQ7KZ85 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.28■■■■■ 4.52
SUPT6HQ7KZ85 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
SUPT6HQ7KZ85 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
SUPT6HQ7KZ85 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
SUPT6HQ7KZ85 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
SUPT6HQ7KZ85 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
SUPT6HQ7KZ85 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC43.23■■■■■ 4.51
SUPT6HQ7KZ85 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC43.23■■■■■ 4.51
SUPT6HQ7KZ85 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.22■■■■■ 4.51
SUPT6HQ7KZ85 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
SUPT6HQ7KZ85 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC43.19■■■■■ 4.5
SUPT6HQ7KZ85 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
SUPT6HQ7KZ85 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
SUPT6HQ7KZ85 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC43.16■■■■■ 4.5
SUPT6HQ7KZ85 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
SUPT6HQ7KZ85 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.14■■■■■ 4.5
SUPT6HQ7KZ85 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
SUPT6HQ7KZ85 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
SUPT6HQ7KZ85 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
SUPT6HQ7KZ85 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC43.06■■■■■ 4.48
SUPT6HQ7KZ85 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC43.04■■■■■ 4.48
SUPT6HQ7KZ85 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.01■■■■■ 4.48
SUPT6HQ7KZ85 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
SUPT6HQ7KZ85 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC42.97■■■■■ 4.47
SUPT6HQ7KZ85 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC42.91■■■■■ 4.46
SUPT6HQ7KZ85 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.9■■■■■ 4.46
SUPT6HQ7KZ85 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.45
SUPT6HQ7KZ85 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC42.87■■■■■ 4.45
SUPT6HQ7KZ85 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC42.87■■■■■ 4.45
SUPT6HQ7KZ85 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
SUPT6HQ7KZ85 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC42.85■■■■■ 4.45
SUPT6HQ7KZ85 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
SUPT6HQ7KZ85 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC42.83■■■■■ 4.45
SUPT6HQ7KZ85 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
SUPT6HQ7KZ85 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
SUPT6HQ7KZ85 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC42.83■■■■■ 4.45
SUPT6HQ7KZ85 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC42.82■■■■■ 4.44
SUPT6HQ7KZ85 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC42.81■■■■■ 4.44
SUPT6HQ7KZ85 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
SUPT6HQ7KZ85 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC42.73■■■■■ 4.43
SUPT6HQ7KZ85 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
SUPT6HQ7KZ85 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
SUPT6HQ7KZ85 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
SUPT6HQ7KZ85 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC42.71■■■■■ 4.43
SUPT6HQ7KZ85 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
SUPT6HQ7KZ85 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
SUPT6HQ7KZ85 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
SUPT6HQ7KZ85 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
SUPT6HQ7KZ85 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC42.64■■■■■ 4.42
SUPT6HQ7KZ85 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.41
SUPT6HQ7KZ85 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
SUPT6HQ7KZ85 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.6■■■■■ 4.41
SUPT6HQ7KZ85 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
SUPT6HQ7KZ85 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.4
SUPT6HQ7KZ85 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.56■■■■■ 4.4
SUPT6HQ7KZ85 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC42.55■■■■■ 4.4
SUPT6HQ7KZ85 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC42.54■■■■■ 4.4
SUPT6HQ7KZ85 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC42.54■■■■■ 4.4
SUPT6HQ7KZ85 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
SUPT6HQ7KZ85 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.52■■■■■ 4.4
SUPT6HQ7KZ85 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC42.52■■■■■ 4.4
SUPT6HQ7KZ85 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC42.51■■■■■ 4.4
SUPT6HQ7KZ85 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC42.51■■■■■ 4.4
SUPT6HQ7KZ85 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC42.51■■■■■ 4.4
SUPT6HQ7KZ85 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
SUPT6HQ7KZ85 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC42.51■■■■■ 4.4
SUPT6HQ7KZ85 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC42.49■■■■■ 4.39
SUPT6HQ7KZ85 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
SUPT6HQ7KZ85 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC42.48■■■■■ 4.39
SUPT6HQ7KZ85 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
SUPT6HQ7KZ85 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC42.47■■■■■ 4.39
SUPT6HQ7KZ85 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
SUPT6HQ7KZ85 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC42.4■■■■■ 4.38
SUPT6HQ7KZ85 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC42.4■■■■■ 4.38
SUPT6HQ7KZ85 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC42.39■■■■■ 4.38
SUPT6HQ7KZ85 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.38
SUPT6HQ7KZ85 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
SUPT6HQ7KZ85 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
SUPT6HQ7KZ85 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.34■■■■■ 4.37
SUPT6HQ7KZ85 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC42.34■■■■■ 4.37
SUPT6HQ7KZ85 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
SUPT6HQ7KZ85 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
SUPT6HQ7KZ85 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC42.33■■■■■ 4.37
SUPT6HQ7KZ85 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC42.33■■■■■ 4.37
SUPT6HQ7KZ85 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC42.32■■■■■ 4.37
SUPT6HQ7KZ85 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC42.31■■■■■ 4.36
SUPT6HQ7KZ85 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms