Protein–RNA interactions for Protein: Q71UM5

RPS27L, 40S ribosomal protein S27-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS27LQ71UM5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RPS27LQ71UM5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RPS27LQ71UM5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RPS27LQ71UM5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RPS27LQ71UM5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RPS27LQ71UM5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RPS27LQ71UM5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RPS27LQ71UM5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RPS27LQ71UM5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
RPS27LQ71UM5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RPS27LQ71UM5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RPS27LQ71UM5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RPS27LQ71UM5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RPS27LQ71UM5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RPS27LQ71UM5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RPS27LQ71UM5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPS27LQ71UM5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPS27LQ71UM5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RPS27LQ71UM5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RPS27LQ71UM5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RPS27LQ71UM5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RPS27LQ71UM5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RPS27LQ71UM5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RPS27LQ71UM5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RPS27LQ71UM5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RPS27LQ71UM5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RPS27LQ71UM5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RPS27LQ71UM5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RPS27LQ71UM5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RPS27LQ71UM5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RPS27LQ71UM5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RPS27LQ71UM5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RPS27LQ71UM5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RPS27LQ71UM5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RPS27LQ71UM5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RPS27LQ71UM5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPS27LQ71UM5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPS27LQ71UM5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RPS27LQ71UM5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPS27LQ71UM5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPS27LQ71UM5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPS27LQ71UM5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
RPS27LQ71UM5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPS27LQ71UM5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RPS27LQ71UM5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RPS27LQ71UM5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RPS27LQ71UM5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RPS27LQ71UM5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RPS27LQ71UM5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RPS27LQ71UM5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RPS27LQ71UM5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RPS27LQ71UM5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
RPS27LQ71UM5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RPS27LQ71UM5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RPS27LQ71UM5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RPS27LQ71UM5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RPS27LQ71UM5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPS27LQ71UM5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPS27LQ71UM5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPS27LQ71UM5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPS27LQ71UM5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPS27LQ71UM5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RPS27LQ71UM5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RPS27LQ71UM5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RPS27LQ71UM5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPS27LQ71UM5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPS27LQ71UM5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RPS27LQ71UM5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPS27LQ71UM5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPS27LQ71UM5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPS27LQ71UM5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPS27LQ71UM5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPS27LQ71UM5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
RPS27LQ71UM5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
RPS27LQ71UM5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPS27LQ71UM5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPS27LQ71UM5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPS27LQ71UM5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
RPS27LQ71UM5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPS27LQ71UM5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPS27LQ71UM5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPS27LQ71UM5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RPS27LQ71UM5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RPS27LQ71UM5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RPS27LQ71UM5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RPS27LQ71UM5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RPS27LQ71UM5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RPS27LQ71UM5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPS27LQ71UM5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RPS27LQ71UM5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RPS27LQ71UM5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPS27LQ71UM5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPS27LQ71UM5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPS27LQ71UM5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPS27LQ71UM5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RPS27LQ71UM5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RPS27LQ71UM5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RPS27LQ71UM5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RPS27LQ71UM5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RPS27LQ71UM5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms