Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

Predictions only

Length 3,546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP34Q70CQ2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP34Q70CQ2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP34Q70CQ2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
USP34Q70CQ2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP34Q70CQ2 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
USP34Q70CQ2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP34Q70CQ2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP34Q70CQ2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP34Q70CQ2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
USP34Q70CQ2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP34Q70CQ2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP34Q70CQ2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
USP34Q70CQ2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP34Q70CQ2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
USP34Q70CQ2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
USP34Q70CQ2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP34Q70CQ2 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP34Q70CQ2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP34Q70CQ2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
USP34Q70CQ2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP34Q70CQ2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP34Q70CQ2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP34Q70CQ2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP34Q70CQ2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP34Q70CQ2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
USP34Q70CQ2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP34Q70CQ2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP34Q70CQ2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP34Q70CQ2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP34Q70CQ2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP34Q70CQ2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP34Q70CQ2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
USP34Q70CQ2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP34Q70CQ2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP34Q70CQ2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP34Q70CQ2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP34Q70CQ2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP34Q70CQ2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP34Q70CQ2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP34Q70CQ2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP34Q70CQ2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP34Q70CQ2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP34Q70CQ2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP34Q70CQ2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
USP34Q70CQ2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP34Q70CQ2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP34Q70CQ2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP34Q70CQ2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP34Q70CQ2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP34Q70CQ2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP34Q70CQ2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP34Q70CQ2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP34Q70CQ2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP34Q70CQ2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP34Q70CQ2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP34Q70CQ2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
USP34Q70CQ2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
USP34Q70CQ2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP34Q70CQ2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP34Q70CQ2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP34Q70CQ2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
USP34Q70CQ2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
USP34Q70CQ2 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP34Q70CQ2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP34Q70CQ2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
USP34Q70CQ2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
USP34Q70CQ2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP34Q70CQ2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP34Q70CQ2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP34Q70CQ2 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP34Q70CQ2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP34Q70CQ2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP34Q70CQ2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP34Q70CQ2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP34Q70CQ2 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP34Q70CQ2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP34Q70CQ2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
USP34Q70CQ2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP34Q70CQ2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP34Q70CQ2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP34Q70CQ2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP34Q70CQ2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP34Q70CQ2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP34Q70CQ2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP34Q70CQ2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP34Q70CQ2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP34Q70CQ2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
USP34Q70CQ2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP34Q70CQ2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP34Q70CQ2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP34Q70CQ2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP34Q70CQ2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP34Q70CQ2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP34Q70CQ2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP34Q70CQ2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP34Q70CQ2 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP34Q70CQ2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
USP34Q70CQ2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
USP34Q70CQ2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms