Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVL6

KIAA1549L, UPF0606 protein KIAA1549L, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549LQ6ZVL6 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KIAA1549LQ6ZVL6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KIAA1549LQ6ZVL6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KIAA1549LQ6ZVL6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KIAA1549LQ6ZVL6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KIAA1549LQ6ZVL6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KIAA1549LQ6ZVL6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KIAA1549LQ6ZVL6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
KIAA1549LQ6ZVL6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KIAA1549LQ6ZVL6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
KIAA1549LQ6ZVL6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KIAA1549LQ6ZVL6 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KIAA1549LQ6ZVL6 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KIAA1549LQ6ZVL6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KIAA1549LQ6ZVL6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
KIAA1549LQ6ZVL6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KIAA1549LQ6ZVL6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KIAA1549LQ6ZVL6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
KIAA1549LQ6ZVL6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KIAA1549LQ6ZVL6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KIAA1549LQ6ZVL6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KIAA1549LQ6ZVL6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KIAA1549LQ6ZVL6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KIAA1549LQ6ZVL6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
KIAA1549LQ6ZVL6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KIAA1549LQ6ZVL6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KIAA1549LQ6ZVL6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KIAA1549LQ6ZVL6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KIAA1549LQ6ZVL6 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KIAA1549LQ6ZVL6 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KIAA1549LQ6ZVL6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KIAA1549LQ6ZVL6 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KIAA1549LQ6ZVL6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KIAA1549LQ6ZVL6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KIAA1549LQ6ZVL6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KIAA1549LQ6ZVL6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KIAA1549LQ6ZVL6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KIAA1549LQ6ZVL6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KIAA1549LQ6ZVL6 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KIAA1549LQ6ZVL6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KIAA1549LQ6ZVL6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KIAA1549LQ6ZVL6 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KIAA1549LQ6ZVL6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KIAA1549LQ6ZVL6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KIAA1549LQ6ZVL6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
KIAA1549LQ6ZVL6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KIAA1549LQ6ZVL6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KIAA1549LQ6ZVL6 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KIAA1549LQ6ZVL6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KIAA1549LQ6ZVL6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KIAA1549LQ6ZVL6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KIAA1549LQ6ZVL6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
KIAA1549LQ6ZVL6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KIAA1549LQ6ZVL6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
KIAA1549LQ6ZVL6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KIAA1549LQ6ZVL6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KIAA1549LQ6ZVL6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KIAA1549LQ6ZVL6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KIAA1549LQ6ZVL6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KIAA1549LQ6ZVL6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KIAA1549LQ6ZVL6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KIAA1549LQ6ZVL6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KIAA1549LQ6ZVL6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KIAA1549LQ6ZVL6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KIAA1549LQ6ZVL6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KIAA1549LQ6ZVL6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KIAA1549LQ6ZVL6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KIAA1549LQ6ZVL6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KIAA1549LQ6ZVL6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KIAA1549LQ6ZVL6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KIAA1549LQ6ZVL6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KIAA1549LQ6ZVL6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KIAA1549LQ6ZVL6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KIAA1549LQ6ZVL6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KIAA1549LQ6ZVL6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KIAA1549LQ6ZVL6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
KIAA1549LQ6ZVL6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
KIAA1549LQ6ZVL6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KIAA1549LQ6ZVL6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KIAA1549LQ6ZVL6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KIAA1549LQ6ZVL6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KIAA1549LQ6ZVL6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
KIAA1549LQ6ZVL6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
KIAA1549LQ6ZVL6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KIAA1549LQ6ZVL6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KIAA1549LQ6ZVL6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
KIAA1549LQ6ZVL6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KIAA1549LQ6ZVL6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KIAA1549LQ6ZVL6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KIAA1549LQ6ZVL6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KIAA1549LQ6ZVL6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KIAA1549LQ6ZVL6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KIAA1549LQ6ZVL6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KIAA1549LQ6ZVL6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KIAA1549LQ6ZVL6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KIAA1549LQ6ZVL6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
KIAA1549LQ6ZVL6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
KIAA1549LQ6ZVL6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KIAA1549LQ6ZVL6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KIAA1549LQ6ZVL6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms