Protein–RNA interactions for Protein: Q6P461

ACSM6, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM6, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM6Q6P461 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSM6Q6P461 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACSM6Q6P461 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACSM6Q6P461 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSM6Q6P461 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSM6Q6P461 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSM6Q6P461 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSM6Q6P461 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSM6Q6P461 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSM6Q6P461 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACSM6Q6P461 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSM6Q6P461 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSM6Q6P461 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSM6Q6P461 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSM6Q6P461 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSM6Q6P461 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACSM6Q6P461 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACSM6Q6P461 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACSM6Q6P461 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACSM6Q6P461 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACSM6Q6P461 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACSM6Q6P461 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACSM6Q6P461 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACSM6Q6P461 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSM6Q6P461 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSM6Q6P461 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSM6Q6P461 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSM6Q6P461 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACSM6Q6P461 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACSM6Q6P461 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACSM6Q6P461 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACSM6Q6P461 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACSM6Q6P461 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACSM6Q6P461 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACSM6Q6P461 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACSM6Q6P461 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACSM6Q6P461 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACSM6Q6P461 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACSM6Q6P461 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACSM6Q6P461 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACSM6Q6P461 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACSM6Q6P461 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACSM6Q6P461 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACSM6Q6P461 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACSM6Q6P461 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACSM6Q6P461 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACSM6Q6P461 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACSM6Q6P461 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACSM6Q6P461 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACSM6Q6P461 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACSM6Q6P461 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACSM6Q6P461 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACSM6Q6P461 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACSM6Q6P461 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ACSM6Q6P461 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACSM6Q6P461 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACSM6Q6P461 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACSM6Q6P461 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSM6Q6P461 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSM6Q6P461 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSM6Q6P461 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSM6Q6P461 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSM6Q6P461 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSM6Q6P461 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSM6Q6P461 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSM6Q6P461 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACSM6Q6P461 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACSM6Q6P461 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSM6Q6P461 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSM6Q6P461 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACSM6Q6P461 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACSM6Q6P461 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACSM6Q6P461 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACSM6Q6P461 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACSM6Q6P461 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACSM6Q6P461 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ACSM6Q6P461 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACSM6Q6P461 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACSM6Q6P461 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACSM6Q6P461 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACSM6Q6P461 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACSM6Q6P461 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACSM6Q6P461 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACSM6Q6P461 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACSM6Q6P461 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACSM6Q6P461 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACSM6Q6P461 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACSM6Q6P461 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACSM6Q6P461 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACSM6Q6P461 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ACSM6Q6P461 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACSM6Q6P461 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACSM6Q6P461 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACSM6Q6P461 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACSM6Q6P461 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACSM6Q6P461 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACSM6Q6P461 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACSM6Q6P461 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ACSM6Q6P461 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
ACSM6Q6P461 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms