Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUP7

PPP4R4, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R4Q6NUP7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PPP4R4Q6NUP7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PPP4R4Q6NUP7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPP4R4Q6NUP7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PPP4R4Q6NUP7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PPP4R4Q6NUP7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PPP4R4Q6NUP7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PPP4R4Q6NUP7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPP4R4Q6NUP7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPP4R4Q6NUP7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PPP4R4Q6NUP7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PPP4R4Q6NUP7 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPP4R4Q6NUP7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPP4R4Q6NUP7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPP4R4Q6NUP7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PPP4R4Q6NUP7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PPP4R4Q6NUP7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PPP4R4Q6NUP7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PPP4R4Q6NUP7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PPP4R4Q6NUP7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PPP4R4Q6NUP7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PPP4R4Q6NUP7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PPP4R4Q6NUP7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PPP4R4Q6NUP7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PPP4R4Q6NUP7 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PPP4R4Q6NUP7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PPP4R4Q6NUP7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PPP4R4Q6NUP7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PPP4R4Q6NUP7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PPP4R4Q6NUP7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PPP4R4Q6NUP7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PPP4R4Q6NUP7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PPP4R4Q6NUP7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PPP4R4Q6NUP7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PPP4R4Q6NUP7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PPP4R4Q6NUP7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PPP4R4Q6NUP7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPP4R4Q6NUP7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPP4R4Q6NUP7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPP4R4Q6NUP7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPP4R4Q6NUP7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PPP4R4Q6NUP7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PPP4R4Q6NUP7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PPP4R4Q6NUP7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PPP4R4Q6NUP7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPP4R4Q6NUP7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPP4R4Q6NUP7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPP4R4Q6NUP7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPP4R4Q6NUP7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPP4R4Q6NUP7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPP4R4Q6NUP7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPP4R4Q6NUP7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPP4R4Q6NUP7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PPP4R4Q6NUP7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPP4R4Q6NUP7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPP4R4Q6NUP7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPP4R4Q6NUP7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPP4R4Q6NUP7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPP4R4Q6NUP7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PPP4R4Q6NUP7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PPP4R4Q6NUP7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PPP4R4Q6NUP7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPP4R4Q6NUP7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPP4R4Q6NUP7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPP4R4Q6NUP7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPP4R4Q6NUP7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPP4R4Q6NUP7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPP4R4Q6NUP7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPP4R4Q6NUP7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPP4R4Q6NUP7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPP4R4Q6NUP7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPP4R4Q6NUP7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PPP4R4Q6NUP7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPP4R4Q6NUP7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PPP4R4Q6NUP7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PPP4R4Q6NUP7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PPP4R4Q6NUP7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PPP4R4Q6NUP7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPP4R4Q6NUP7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPP4R4Q6NUP7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPP4R4Q6NUP7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPP4R4Q6NUP7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPP4R4Q6NUP7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPP4R4Q6NUP7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPP4R4Q6NUP7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPP4R4Q6NUP7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPP4R4Q6NUP7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPP4R4Q6NUP7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPP4R4Q6NUP7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PPP4R4Q6NUP7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPP4R4Q6NUP7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPP4R4Q6NUP7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPP4R4Q6NUP7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPP4R4Q6NUP7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPP4R4Q6NUP7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPP4R4Q6NUP7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPP4R4Q6NUP7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPP4R4Q6NUP7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PPP4R4Q6NUP7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PPP4R4Q6NUP7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms