Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT46

GAGE2A, G antigen 2A, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAGE2AQ6NT46 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GAGE2AQ6NT46 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GAGE2AQ6NT46 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GAGE2AQ6NT46 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GAGE2AQ6NT46 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GAGE2AQ6NT46 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GAGE2AQ6NT46 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GAGE2AQ6NT46 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GAGE2AQ6NT46 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GAGE2AQ6NT46 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GAGE2AQ6NT46 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GAGE2AQ6NT46 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GAGE2AQ6NT46 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GAGE2AQ6NT46 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GAGE2AQ6NT46 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GAGE2AQ6NT46 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GAGE2AQ6NT46 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GAGE2AQ6NT46 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GAGE2AQ6NT46 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GAGE2AQ6NT46 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GAGE2AQ6NT46 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GAGE2AQ6NT46 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GAGE2AQ6NT46 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GAGE2AQ6NT46 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GAGE2AQ6NT46 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GAGE2AQ6NT46 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GAGE2AQ6NT46 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GAGE2AQ6NT46 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GAGE2AQ6NT46 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GAGE2AQ6NT46 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GAGE2AQ6NT46 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GAGE2AQ6NT46 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GAGE2AQ6NT46 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GAGE2AQ6NT46 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GAGE2AQ6NT46 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GAGE2AQ6NT46 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
GAGE2AQ6NT46 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GAGE2AQ6NT46 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GAGE2AQ6NT46 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GAGE2AQ6NT46 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GAGE2AQ6NT46 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GAGE2AQ6NT46 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GAGE2AQ6NT46 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GAGE2AQ6NT46 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GAGE2AQ6NT46 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GAGE2AQ6NT46 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GAGE2AQ6NT46 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GAGE2AQ6NT46 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GAGE2AQ6NT46 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GAGE2AQ6NT46 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GAGE2AQ6NT46 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GAGE2AQ6NT46 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GAGE2AQ6NT46 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GAGE2AQ6NT46 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GAGE2AQ6NT46 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GAGE2AQ6NT46 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GAGE2AQ6NT46 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GAGE2AQ6NT46 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GAGE2AQ6NT46 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
GAGE2AQ6NT46 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GAGE2AQ6NT46 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GAGE2AQ6NT46 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GAGE2AQ6NT46 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GAGE2AQ6NT46 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GAGE2AQ6NT46 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GAGE2AQ6NT46 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GAGE2AQ6NT46 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GAGE2AQ6NT46 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GAGE2AQ6NT46 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GAGE2AQ6NT46 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GAGE2AQ6NT46 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GAGE2AQ6NT46 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GAGE2AQ6NT46 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GAGE2AQ6NT46 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GAGE2AQ6NT46 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GAGE2AQ6NT46 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GAGE2AQ6NT46 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GAGE2AQ6NT46 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GAGE2AQ6NT46 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GAGE2AQ6NT46 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GAGE2AQ6NT46 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GAGE2AQ6NT46 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GAGE2AQ6NT46 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GAGE2AQ6NT46 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GAGE2AQ6NT46 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GAGE2AQ6NT46 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GAGE2AQ6NT46 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GAGE2AQ6NT46 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GAGE2AQ6NT46 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GAGE2AQ6NT46 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GAGE2AQ6NT46 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GAGE2AQ6NT46 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GAGE2AQ6NT46 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GAGE2AQ6NT46 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GAGE2AQ6NT46 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GAGE2AQ6NT46 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GAGE2AQ6NT46 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GAGE2AQ6NT46 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GAGE2AQ6NT46 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GAGE2AQ6NT46 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms