Protein–RNA interactions for Protein: Q68G75

LEMD1, LEM domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD1Q68G75 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LEMD1Q68G75 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LEMD1Q68G75 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LEMD1Q68G75 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LEMD1Q68G75 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LEMD1Q68G75 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LEMD1Q68G75 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LEMD1Q68G75 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LEMD1Q68G75 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LEMD1Q68G75 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LEMD1Q68G75 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LEMD1Q68G75 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LEMD1Q68G75 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LEMD1Q68G75 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LEMD1Q68G75 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LEMD1Q68G75 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LEMD1Q68G75 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LEMD1Q68G75 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LEMD1Q68G75 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LEMD1Q68G75 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LEMD1Q68G75 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LEMD1Q68G75 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LEMD1Q68G75 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LEMD1Q68G75 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LEMD1Q68G75 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LEMD1Q68G75 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LEMD1Q68G75 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LEMD1Q68G75 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LEMD1Q68G75 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LEMD1Q68G75 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LEMD1Q68G75 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LEMD1Q68G75 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LEMD1Q68G75 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LEMD1Q68G75 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LEMD1Q68G75 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LEMD1Q68G75 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LEMD1Q68G75 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LEMD1Q68G75 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LEMD1Q68G75 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LEMD1Q68G75 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LEMD1Q68G75 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LEMD1Q68G75 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LEMD1Q68G75 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LEMD1Q68G75 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LEMD1Q68G75 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LEMD1Q68G75 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LEMD1Q68G75 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LEMD1Q68G75 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LEMD1Q68G75 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LEMD1Q68G75 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LEMD1Q68G75 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LEMD1Q68G75 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LEMD1Q68G75 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LEMD1Q68G75 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LEMD1Q68G75 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LEMD1Q68G75 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LEMD1Q68G75 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LEMD1Q68G75 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LEMD1Q68G75 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LEMD1Q68G75 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LEMD1Q68G75 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LEMD1Q68G75 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LEMD1Q68G75 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LEMD1Q68G75 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LEMD1Q68G75 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LEMD1Q68G75 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LEMD1Q68G75 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LEMD1Q68G75 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LEMD1Q68G75 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LEMD1Q68G75 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LEMD1Q68G75 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LEMD1Q68G75 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LEMD1Q68G75 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LEMD1Q68G75 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LEMD1Q68G75 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LEMD1Q68G75 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
LEMD1Q68G75 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LEMD1Q68G75 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LEMD1Q68G75 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LEMD1Q68G75 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LEMD1Q68G75 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LEMD1Q68G75 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LEMD1Q68G75 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LEMD1Q68G75 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
LEMD1Q68G75 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LEMD1Q68G75 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LEMD1Q68G75 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LEMD1Q68G75 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LEMD1Q68G75 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LEMD1Q68G75 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LEMD1Q68G75 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
LEMD1Q68G75 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LEMD1Q68G75 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LEMD1Q68G75 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LEMD1Q68G75 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LEMD1Q68G75 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LEMD1Q68G75 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LEMD1Q68G75 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LEMD1Q68G75 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LEMD1Q68G75 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms