Protein–RNA interactions for Protein: Q68D10

SPTY2D1, Protein SPT2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTY2D1Q68D10 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SPTY2D1Q68D10 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SPTY2D1Q68D10 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SPTY2D1Q68D10 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SPTY2D1Q68D10 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SPTY2D1Q68D10 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SPTY2D1Q68D10 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SPTY2D1Q68D10 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
SPTY2D1Q68D10 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SPTY2D1Q68D10 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
SPTY2D1Q68D10 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■■□ 3
SPTY2D1Q68D10 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
SPTY2D1Q68D10 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
SPTY2D1Q68D10 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SPTY2D1Q68D10 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SPTY2D1Q68D10 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SPTY2D1Q68D10 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SPTY2D1Q68D10 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SPTY2D1Q68D10 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SPTY2D1Q68D10 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SPTY2D1Q68D10 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SPTY2D1Q68D10 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
SPTY2D1Q68D10 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SPTY2D1Q68D10 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SPTY2D1Q68D10 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SPTY2D1Q68D10 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SPTY2D1Q68D10 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
SPTY2D1Q68D10 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
SPTY2D1Q68D10 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
SPTY2D1Q68D10 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SPTY2D1Q68D10 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SPTY2D1Q68D10 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SPTY2D1Q68D10 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SPTY2D1Q68D10 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
SPTY2D1Q68D10 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
SPTY2D1Q68D10 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SPTY2D1Q68D10 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
SPTY2D1Q68D10 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SPTY2D1Q68D10 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SPTY2D1Q68D10 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
SPTY2D1Q68D10 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SPTY2D1Q68D10 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
SPTY2D1Q68D10 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SPTY2D1Q68D10 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SPTY2D1Q68D10 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SPTY2D1Q68D10 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SPTY2D1Q68D10 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SPTY2D1Q68D10 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SPTY2D1Q68D10 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SPTY2D1Q68D10 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SPTY2D1Q68D10 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SPTY2D1Q68D10 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
SPTY2D1Q68D10 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SPTY2D1Q68D10 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SPTY2D1Q68D10 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SPTY2D1Q68D10 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SPTY2D1Q68D10 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
SPTY2D1Q68D10 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SPTY2D1Q68D10 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SPTY2D1Q68D10 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SPTY2D1Q68D10 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
SPTY2D1Q68D10 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SPTY2D1Q68D10 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
SPTY2D1Q68D10 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
SPTY2D1Q68D10 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
SPTY2D1Q68D10 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
SPTY2D1Q68D10 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
SPTY2D1Q68D10 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SPTY2D1Q68D10 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
SPTY2D1Q68D10 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
SPTY2D1Q68D10 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SPTY2D1Q68D10 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
SPTY2D1Q68D10 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
SPTY2D1Q68D10 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SPTY2D1Q68D10 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SPTY2D1Q68D10 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
SPTY2D1Q68D10 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SPTY2D1Q68D10 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SPTY2D1Q68D10 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SPTY2D1Q68D10 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
SPTY2D1Q68D10 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC33.1■■■□□ 2.89
SPTY2D1Q68D10 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SPTY2D1Q68D10 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SPTY2D1Q68D10 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SPTY2D1Q68D10 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SPTY2D1Q68D10 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SPTY2D1Q68D10 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
SPTY2D1Q68D10 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
SPTY2D1Q68D10 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
SPTY2D1Q68D10 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
SPTY2D1Q68D10 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SPTY2D1Q68D10 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SPTY2D1Q68D10 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SPTY2D1Q68D10 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
SPTY2D1Q68D10 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
SPTY2D1Q68D10 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SPTY2D1Q68D10 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SPTY2D1Q68D10 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SPTY2D1Q68D10 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
SPTY2D1Q68D10 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms