Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG99

LYSMD4, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSMD4Q5XG99 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LYSMD4Q5XG99 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
LYSMD4Q5XG99 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LYSMD4Q5XG99 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
LYSMD4Q5XG99 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LYSMD4Q5XG99 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
LYSMD4Q5XG99 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LYSMD4Q5XG99 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LYSMD4Q5XG99 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LYSMD4Q5XG99 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LYSMD4Q5XG99 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LYSMD4Q5XG99 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LYSMD4Q5XG99 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LYSMD4Q5XG99 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LYSMD4Q5XG99 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LYSMD4Q5XG99 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LYSMD4Q5XG99 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LYSMD4Q5XG99 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LYSMD4Q5XG99 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LYSMD4Q5XG99 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LYSMD4Q5XG99 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LYSMD4Q5XG99 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LYSMD4Q5XG99 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LYSMD4Q5XG99 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
LYSMD4Q5XG99 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LYSMD4Q5XG99 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LYSMD4Q5XG99 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LYSMD4Q5XG99 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LYSMD4Q5XG99 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LYSMD4Q5XG99 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LYSMD4Q5XG99 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LYSMD4Q5XG99 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LYSMD4Q5XG99 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LYSMD4Q5XG99 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LYSMD4Q5XG99 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
LYSMD4Q5XG99 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
LYSMD4Q5XG99 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LYSMD4Q5XG99 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
LYSMD4Q5XG99 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LYSMD4Q5XG99 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LYSMD4Q5XG99 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LYSMD4Q5XG99 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LYSMD4Q5XG99 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LYSMD4Q5XG99 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
LYSMD4Q5XG99 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LYSMD4Q5XG99 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LYSMD4Q5XG99 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LYSMD4Q5XG99 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LYSMD4Q5XG99 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LYSMD4Q5XG99 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
LYSMD4Q5XG99 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
LYSMD4Q5XG99 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
LYSMD4Q5XG99 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LYSMD4Q5XG99 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LYSMD4Q5XG99 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LYSMD4Q5XG99 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LYSMD4Q5XG99 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LYSMD4Q5XG99 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LYSMD4Q5XG99 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
LYSMD4Q5XG99 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LYSMD4Q5XG99 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LYSMD4Q5XG99 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LYSMD4Q5XG99 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LYSMD4Q5XG99 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LYSMD4Q5XG99 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
LYSMD4Q5XG99 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LYSMD4Q5XG99 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LYSMD4Q5XG99 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LYSMD4Q5XG99 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LYSMD4Q5XG99 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LYSMD4Q5XG99 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LYSMD4Q5XG99 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LYSMD4Q5XG99 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LYSMD4Q5XG99 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LYSMD4Q5XG99 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LYSMD4Q5XG99 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LYSMD4Q5XG99 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LYSMD4Q5XG99 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LYSMD4Q5XG99 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LYSMD4Q5XG99 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LYSMD4Q5XG99 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
LYSMD4Q5XG99 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LYSMD4Q5XG99 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LYSMD4Q5XG99 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LYSMD4Q5XG99 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LYSMD4Q5XG99 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LYSMD4Q5XG99 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LYSMD4Q5XG99 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LYSMD4Q5XG99 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LYSMD4Q5XG99 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LYSMD4Q5XG99 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LYSMD4Q5XG99 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LYSMD4Q5XG99 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LYSMD4Q5XG99 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LYSMD4Q5XG99 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LYSMD4Q5XG99 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LYSMD4Q5XG99 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LYSMD4Q5XG99 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LYSMD4Q5XG99 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LYSMD4Q5XG99 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms