Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV67

PPRC1, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPRC1Q5VV67 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC44.4■■■■■ 4.7
PPRC1Q5VV67 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC44.4■■■■■ 4.7
PPRC1Q5VV67 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.39■■■■■ 4.7
PPRC1Q5VV67 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
PPRC1Q5VV67 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC44.33■■■■■ 4.69
PPRC1Q5VV67 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC44.28■■■■■ 4.68
PPRC1Q5VV67 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC44.28■■■■■ 4.68
PPRC1Q5VV67 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
PPRC1Q5VV67 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.26■■■■■ 4.68
PPRC1Q5VV67 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC44.26■■■■■ 4.68
PPRC1Q5VV67 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC44.26■■■■■ 4.68
PPRC1Q5VV67 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
PPRC1Q5VV67 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC44.24■■■■■ 4.67
PPRC1Q5VV67 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
PPRC1Q5VV67 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.22■■■■■ 4.67
PPRC1Q5VV67 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.22■■■■■ 4.67
PPRC1Q5VV67 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.21■■■■■ 4.67
PPRC1Q5VV67 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.21■■■■■ 4.67
PPRC1Q5VV67 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC44.2■■■■■ 4.67
PPRC1Q5VV67 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC44.19■■■■■ 4.67
PPRC1Q5VV67 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC44.17■■■■■ 4.66
PPRC1Q5VV67 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC44.14■■■■■ 4.66
PPRC1Q5VV67 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC44.13■■■■■ 4.66
PPRC1Q5VV67 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC44.13■■■■■ 4.65
PPRC1Q5VV67 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
PPRC1Q5VV67 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
PPRC1Q5VV67 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
PPRC1Q5VV67 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.07■■■■■ 4.64
PPRC1Q5VV67 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC44.04■■■■■ 4.64
PPRC1Q5VV67 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC44.03■■■■■ 4.64
PPRC1Q5VV67 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC43.99■■■■■ 4.63
PPRC1Q5VV67 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
PPRC1Q5VV67 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.98■■■■■ 4.63
PPRC1Q5VV67 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
PPRC1Q5VV67 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
PPRC1Q5VV67 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC43.91■■■■■ 4.62
PPRC1Q5VV67 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC43.9■■■■■ 4.62
PPRC1Q5VV67 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC43.89■■■■■ 4.62
PPRC1Q5VV67 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
PPRC1Q5VV67 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC43.87■■■■■ 4.61
PPRC1Q5VV67 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC43.87■■■■■ 4.61
PPRC1Q5VV67 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
PPRC1Q5VV67 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC43.85■■■■■ 4.61
PPRC1Q5VV67 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
PPRC1Q5VV67 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC43.84■■■■■ 4.61
PPRC1Q5VV67 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.83■■■■■ 4.61
PPRC1Q5VV67 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
PPRC1Q5VV67 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC43.81■■■■■ 4.6
PPRC1Q5VV67 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.79■■■■■ 4.6
PPRC1Q5VV67 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC43.79■■■■■ 4.6
PPRC1Q5VV67 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC43.77■■■■■ 4.6
PPRC1Q5VV67 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC43.76■■■■■ 4.6
PPRC1Q5VV67 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC43.75■■■■■ 4.59
PPRC1Q5VV67 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC43.74■■■■■ 4.59
PPRC1Q5VV67 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC43.74■■■■■ 4.59
PPRC1Q5VV67 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
PPRC1Q5VV67 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.72■■■■■ 4.59
PPRC1Q5VV67 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.71■■■■■ 4.59
PPRC1Q5VV67 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC43.71■■■■■ 4.59
PPRC1Q5VV67 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
PPRC1Q5VV67 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC43.7■■■■■ 4.59
PPRC1Q5VV67 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.58
PPRC1Q5VV67 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.67■■■■■ 4.58
PPRC1Q5VV67 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
PPRC1Q5VV67 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
PPRC1Q5VV67 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
PPRC1Q5VV67 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC43.64■■■■■ 4.58
PPRC1Q5VV67 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.62■■■■■ 4.57
PPRC1Q5VV67 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.62■■■■■ 4.57
PPRC1Q5VV67 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC43.61■■■■■ 4.57
PPRC1Q5VV67 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC43.6■■■■■ 4.57
PPRC1Q5VV67 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC43.59■■■■■ 4.57
PPRC1Q5VV67 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
PPRC1Q5VV67 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC43.56■■■■■ 4.56
PPRC1Q5VV67 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
PPRC1Q5VV67 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
PPRC1Q5VV67 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC43.53■■■■■ 4.56
PPRC1Q5VV67 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC43.52■■■■■ 4.56
PPRC1Q5VV67 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
PPRC1Q5VV67 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
PPRC1Q5VV67 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
PPRC1Q5VV67 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC43.45■■■■■ 4.55
PPRC1Q5VV67 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC43.43■■■■■ 4.54
PPRC1Q5VV67 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
PPRC1Q5VV67 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC43.39■■■■■ 4.54
PPRC1Q5VV67 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC43.39■■■■■ 4.54
PPRC1Q5VV67 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC43.38■■■■■ 4.54
PPRC1Q5VV67 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC43.38■■■■■ 4.53
PPRC1Q5VV67 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC43.33■■■■■ 4.53
PPRC1Q5VV67 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC43.33■■■■■ 4.53
PPRC1Q5VV67 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
PPRC1Q5VV67 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC43.32■■■■■ 4.53
PPRC1Q5VV67 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
PPRC1Q5VV67 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
PPRC1Q5VV67 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC43.29■■■■■ 4.52
PPRC1Q5VV67 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
PPRC1Q5VV67 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.27■■■■■ 4.52
PPRC1Q5VV67 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
PPRC1Q5VV67 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
PPRC1Q5VV67 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC43.25■■■■■ 4.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms