Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSR9

SPANXN1, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N1, humanhuman

Predictions only

Length 72 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN1Q5VSR9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPANXN1Q5VSR9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPANXN1Q5VSR9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPANXN1Q5VSR9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPANXN1Q5VSR9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPANXN1Q5VSR9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPANXN1Q5VSR9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPANXN1Q5VSR9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPANXN1Q5VSR9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPANXN1Q5VSR9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPANXN1Q5VSR9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPANXN1Q5VSR9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPANXN1Q5VSR9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPANXN1Q5VSR9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPANXN1Q5VSR9 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPANXN1Q5VSR9 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SPANXN1Q5VSR9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPANXN1Q5VSR9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPANXN1Q5VSR9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPANXN1Q5VSR9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPANXN1Q5VSR9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPANXN1Q5VSR9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPANXN1Q5VSR9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SPANXN1Q5VSR9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPANXN1Q5VSR9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPANXN1Q5VSR9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPANXN1Q5VSR9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPANXN1Q5VSR9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPANXN1Q5VSR9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPANXN1Q5VSR9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPANXN1Q5VSR9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPANXN1Q5VSR9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPANXN1Q5VSR9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPANXN1Q5VSR9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SPANXN1Q5VSR9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPANXN1Q5VSR9 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPANXN1Q5VSR9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPANXN1Q5VSR9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPANXN1Q5VSR9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPANXN1Q5VSR9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPANXN1Q5VSR9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPANXN1Q5VSR9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPANXN1Q5VSR9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPANXN1Q5VSR9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPANXN1Q5VSR9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPANXN1Q5VSR9 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPANXN1Q5VSR9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPANXN1Q5VSR9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPANXN1Q5VSR9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPANXN1Q5VSR9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPANXN1Q5VSR9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPANXN1Q5VSR9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPANXN1Q5VSR9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPANXN1Q5VSR9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPANXN1Q5VSR9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPANXN1Q5VSR9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPANXN1Q5VSR9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPANXN1Q5VSR9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPANXN1Q5VSR9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPANXN1Q5VSR9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPANXN1Q5VSR9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPANXN1Q5VSR9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPANXN1Q5VSR9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPANXN1Q5VSR9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPANXN1Q5VSR9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPANXN1Q5VSR9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPANXN1Q5VSR9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SPANXN1Q5VSR9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SPANXN1Q5VSR9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPANXN1Q5VSR9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SPANXN1Q5VSR9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPANXN1Q5VSR9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPANXN1Q5VSR9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPANXN1Q5VSR9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPANXN1Q5VSR9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPANXN1Q5VSR9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPANXN1Q5VSR9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPANXN1Q5VSR9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPANXN1Q5VSR9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SPANXN1Q5VSR9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SPANXN1Q5VSR9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPANXN1Q5VSR9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPANXN1Q5VSR9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPANXN1Q5VSR9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPANXN1Q5VSR9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPANXN1Q5VSR9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPANXN1Q5VSR9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPANXN1Q5VSR9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPANXN1Q5VSR9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPANXN1Q5VSR9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPANXN1Q5VSR9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPANXN1Q5VSR9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPANXN1Q5VSR9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPANXN1Q5VSR9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPANXN1Q5VSR9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPANXN1Q5VSR9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPANXN1Q5VSR9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPANXN1Q5VSR9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPANXN1Q5VSR9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SPANXN1Q5VSR9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms