Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
NUP188Q5SRE5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
NUP188Q5SRE5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
NUP188Q5SRE5 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
NUP188Q5SRE5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
NUP188Q5SRE5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
NUP188Q5SRE5 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
NUP188Q5SRE5 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
NUP188Q5SRE5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
NUP188Q5SRE5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
NUP188Q5SRE5 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
NUP188Q5SRE5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
NUP188Q5SRE5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
NUP188Q5SRE5 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
NUP188Q5SRE5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.51
NUP188Q5SRE5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC37■■■■□ 3.51
NUP188Q5SRE5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC36.96■■■■□ 3.51
NUP188Q5SRE5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
NUP188Q5SRE5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
NUP188Q5SRE5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
NUP188Q5SRE5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
NUP188Q5SRE5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
NUP188Q5SRE5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
NUP188Q5SRE5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC36.92■■■■□ 3.5
NUP188Q5SRE5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.91■■■■□ 3.5
NUP188Q5SRE5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
NUP188Q5SRE5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
NUP188Q5SRE5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
NUP188Q5SRE5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
NUP188Q5SRE5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
NUP188Q5SRE5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC36.85■■■■□ 3.49
NUP188Q5SRE5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
NUP188Q5SRE5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
NUP188Q5SRE5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
NUP188Q5SRE5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
NUP188Q5SRE5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
NUP188Q5SRE5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC36.73■■■■□ 3.47
NUP188Q5SRE5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
NUP188Q5SRE5 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
NUP188Q5SRE5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
NUP188Q5SRE5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
NUP188Q5SRE5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
NUP188Q5SRE5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
NUP188Q5SRE5 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
NUP188Q5SRE5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC36.65■■■■□ 3.46
NUP188Q5SRE5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC36.65■■■■□ 3.46
NUP188Q5SRE5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.65■■■■□ 3.46
NUP188Q5SRE5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
NUP188Q5SRE5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
NUP188Q5SRE5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
NUP188Q5SRE5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
NUP188Q5SRE5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
NUP188Q5SRE5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
NUP188Q5SRE5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
NUP188Q5SRE5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
NUP188Q5SRE5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
NUP188Q5SRE5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
NUP188Q5SRE5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
NUP188Q5SRE5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
NUP188Q5SRE5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
NUP188Q5SRE5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC36.51■■■■□ 3.43
NUP188Q5SRE5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
NUP188Q5SRE5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
NUP188Q5SRE5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
NUP188Q5SRE5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
NUP188Q5SRE5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
NUP188Q5SRE5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
NUP188Q5SRE5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
NUP188Q5SRE5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
NUP188Q5SRE5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
NUP188Q5SRE5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
NUP188Q5SRE5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
NUP188Q5SRE5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
NUP188Q5SRE5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
NUP188Q5SRE5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC36.42■■■■□ 3.42
NUP188Q5SRE5 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
NUP188Q5SRE5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
NUP188Q5SRE5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
NUP188Q5SRE5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
NUP188Q5SRE5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
NUP188Q5SRE5 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
NUP188Q5SRE5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
NUP188Q5SRE5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
NUP188Q5SRE5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
NUP188Q5SRE5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
NUP188Q5SRE5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
NUP188Q5SRE5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
NUP188Q5SRE5 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
NUP188Q5SRE5 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
NUP188Q5SRE5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
NUP188Q5SRE5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
NUP188Q5SRE5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.39
NUP188Q5SRE5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC36.25■■■■□ 3.39
NUP188Q5SRE5 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
NUP188Q5SRE5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
NUP188Q5SRE5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
NUP188Q5SRE5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
NUP188Q5SRE5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
NUP188Q5SRE5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
NUP188Q5SRE5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.6 ms