Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNT2

TMEM201, Transmembrane protein 201, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM201Q5SNT2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM201Q5SNT2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM201Q5SNT2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM201Q5SNT2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM201Q5SNT2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM201Q5SNT2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM201Q5SNT2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM201Q5SNT2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM201Q5SNT2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM201Q5SNT2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM201Q5SNT2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM201Q5SNT2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM201Q5SNT2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TMEM201Q5SNT2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM201Q5SNT2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM201Q5SNT2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM201Q5SNT2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM201Q5SNT2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM201Q5SNT2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM201Q5SNT2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM201Q5SNT2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM201Q5SNT2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM201Q5SNT2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM201Q5SNT2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM201Q5SNT2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM201Q5SNT2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM201Q5SNT2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM201Q5SNT2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM201Q5SNT2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM201Q5SNT2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM201Q5SNT2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM201Q5SNT2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM201Q5SNT2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM201Q5SNT2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM201Q5SNT2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM201Q5SNT2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM201Q5SNT2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM201Q5SNT2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM201Q5SNT2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM201Q5SNT2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM201Q5SNT2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM201Q5SNT2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM201Q5SNT2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM201Q5SNT2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM201Q5SNT2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM201Q5SNT2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM201Q5SNT2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM201Q5SNT2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM201Q5SNT2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM201Q5SNT2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM201Q5SNT2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM201Q5SNT2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM201Q5SNT2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM201Q5SNT2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM201Q5SNT2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM201Q5SNT2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM201Q5SNT2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM201Q5SNT2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM201Q5SNT2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM201Q5SNT2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM201Q5SNT2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM201Q5SNT2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM201Q5SNT2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM201Q5SNT2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM201Q5SNT2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM201Q5SNT2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM201Q5SNT2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM201Q5SNT2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM201Q5SNT2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM201Q5SNT2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM201Q5SNT2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM201Q5SNT2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM201Q5SNT2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM201Q5SNT2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM201Q5SNT2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM201Q5SNT2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM201Q5SNT2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM201Q5SNT2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM201Q5SNT2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM201Q5SNT2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM201Q5SNT2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM201Q5SNT2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM201Q5SNT2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM201Q5SNT2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM201Q5SNT2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TMEM201Q5SNT2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM201Q5SNT2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM201Q5SNT2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM201Q5SNT2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM201Q5SNT2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM201Q5SNT2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM201Q5SNT2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM201Q5SNT2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM201Q5SNT2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM201Q5SNT2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM201Q5SNT2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM201Q5SNT2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM201Q5SNT2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM201Q5SNT2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM201Q5SNT2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms