Protein–RNA interactions for Protein: Q5C9Z4

NOM1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOM1Q5C9Z4 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NOM1Q5C9Z4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
NOM1Q5C9Z4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NOM1Q5C9Z4 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NOM1Q5C9Z4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NOM1Q5C9Z4 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
NOM1Q5C9Z4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NOM1Q5C9Z4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
NOM1Q5C9Z4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC33.24■■■□□ 2.91
NOM1Q5C9Z4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NOM1Q5C9Z4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
NOM1Q5C9Z4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
NOM1Q5C9Z4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
NOM1Q5C9Z4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
NOM1Q5C9Z4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NOM1Q5C9Z4 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
NOM1Q5C9Z4 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
NOM1Q5C9Z4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NOM1Q5C9Z4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NOM1Q5C9Z4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
NOM1Q5C9Z4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
NOM1Q5C9Z4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
NOM1Q5C9Z4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
NOM1Q5C9Z4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
NOM1Q5C9Z4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
NOM1Q5C9Z4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
NOM1Q5C9Z4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
NOM1Q5C9Z4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
NOM1Q5C9Z4 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
NOM1Q5C9Z4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
NOM1Q5C9Z4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC33.01■■■□□ 2.88
NOM1Q5C9Z4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
NOM1Q5C9Z4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
NOM1Q5C9Z4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
NOM1Q5C9Z4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
NOM1Q5C9Z4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
NOM1Q5C9Z4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
NOM1Q5C9Z4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
NOM1Q5C9Z4 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NOM1Q5C9Z4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
NOM1Q5C9Z4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
NOM1Q5C9Z4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
NOM1Q5C9Z4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
NOM1Q5C9Z4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
NOM1Q5C9Z4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
NOM1Q5C9Z4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
NOM1Q5C9Z4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
NOM1Q5C9Z4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
NOM1Q5C9Z4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
NOM1Q5C9Z4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
NOM1Q5C9Z4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
NOM1Q5C9Z4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
NOM1Q5C9Z4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
NOM1Q5C9Z4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
NOM1Q5C9Z4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
NOM1Q5C9Z4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
NOM1Q5C9Z4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
NOM1Q5C9Z4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
NOM1Q5C9Z4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
NOM1Q5C9Z4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
NOM1Q5C9Z4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
NOM1Q5C9Z4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
NOM1Q5C9Z4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
NOM1Q5C9Z4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
NOM1Q5C9Z4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
NOM1Q5C9Z4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
NOM1Q5C9Z4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
NOM1Q5C9Z4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
NOM1Q5C9Z4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
NOM1Q5C9Z4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
NOM1Q5C9Z4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
NOM1Q5C9Z4 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
NOM1Q5C9Z4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
NOM1Q5C9Z4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
NOM1Q5C9Z4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
NOM1Q5C9Z4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
NOM1Q5C9Z4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
NOM1Q5C9Z4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
NOM1Q5C9Z4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
NOM1Q5C9Z4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
NOM1Q5C9Z4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
NOM1Q5C9Z4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
NOM1Q5C9Z4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
NOM1Q5C9Z4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
NOM1Q5C9Z4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
NOM1Q5C9Z4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
NOM1Q5C9Z4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
NOM1Q5C9Z4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
NOM1Q5C9Z4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
NOM1Q5C9Z4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
NOM1Q5C9Z4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
NOM1Q5C9Z4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
NOM1Q5C9Z4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
NOM1Q5C9Z4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
NOM1Q5C9Z4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
NOM1Q5C9Z4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
NOM1Q5C9Z4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
NOM1Q5C9Z4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
NOM1Q5C9Z4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NOM1Q5C9Z4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms