Protein–RNA interactions for Protein: Q53EV4

LRRC23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC23Q53EV4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRC23Q53EV4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LRRC23Q53EV4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRC23Q53EV4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRC23Q53EV4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRC23Q53EV4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRC23Q53EV4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRC23Q53EV4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRC23Q53EV4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRRC23Q53EV4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRRC23Q53EV4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRRC23Q53EV4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRRC23Q53EV4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
LRRC23Q53EV4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRRC23Q53EV4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRRC23Q53EV4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRRC23Q53EV4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRC23Q53EV4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRC23Q53EV4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRRC23Q53EV4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRRC23Q53EV4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRRC23Q53EV4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRC23Q53EV4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRC23Q53EV4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRC23Q53EV4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRC23Q53EV4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRC23Q53EV4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRC23Q53EV4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRRC23Q53EV4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRRC23Q53EV4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRC23Q53EV4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRC23Q53EV4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRC23Q53EV4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
LRRC23Q53EV4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
LRRC23Q53EV4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LRRC23Q53EV4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRC23Q53EV4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRC23Q53EV4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRC23Q53EV4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRC23Q53EV4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LRRC23Q53EV4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRC23Q53EV4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRC23Q53EV4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC23Q53EV4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC23Q53EV4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC23Q53EV4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC23Q53EV4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC23Q53EV4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC23Q53EV4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC23Q53EV4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC23Q53EV4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC23Q53EV4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC23Q53EV4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC23Q53EV4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC23Q53EV4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC23Q53EV4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC23Q53EV4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC23Q53EV4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC23Q53EV4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC23Q53EV4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC23Q53EV4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC23Q53EV4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC23Q53EV4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC23Q53EV4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC23Q53EV4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC23Q53EV4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC23Q53EV4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC23Q53EV4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LRRC23Q53EV4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC23Q53EV4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRC23Q53EV4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRC23Q53EV4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRC23Q53EV4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC23Q53EV4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC23Q53EV4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC23Q53EV4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC23Q53EV4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC23Q53EV4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC23Q53EV4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC23Q53EV4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC23Q53EV4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRC23Q53EV4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRC23Q53EV4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC23Q53EV4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC23Q53EV4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC23Q53EV4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC23Q53EV4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRC23Q53EV4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC23Q53EV4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC23Q53EV4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC23Q53EV4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC23Q53EV4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC23Q53EV4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC23Q53EV4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC23Q53EV4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC23Q53EV4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC23Q53EV4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC23Q53EV4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC23Q53EV4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
LRRC23Q53EV4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms