Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDE5

SVEP1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 3,571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVEP1Q4LDE5 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SVEP1Q4LDE5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SVEP1Q4LDE5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SVEP1Q4LDE5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SVEP1Q4LDE5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SVEP1Q4LDE5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SVEP1Q4LDE5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SVEP1Q4LDE5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SVEP1Q4LDE5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SVEP1Q4LDE5 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SVEP1Q4LDE5 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SVEP1Q4LDE5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SVEP1Q4LDE5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SVEP1Q4LDE5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SVEP1Q4LDE5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SVEP1Q4LDE5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SVEP1Q4LDE5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SVEP1Q4LDE5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SVEP1Q4LDE5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SVEP1Q4LDE5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SVEP1Q4LDE5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SVEP1Q4LDE5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SVEP1Q4LDE5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SVEP1Q4LDE5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SVEP1Q4LDE5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SVEP1Q4LDE5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SVEP1Q4LDE5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SVEP1Q4LDE5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SVEP1Q4LDE5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SVEP1Q4LDE5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SVEP1Q4LDE5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SVEP1Q4LDE5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SVEP1Q4LDE5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SVEP1Q4LDE5 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SVEP1Q4LDE5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SVEP1Q4LDE5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SVEP1Q4LDE5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SVEP1Q4LDE5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SVEP1Q4LDE5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SVEP1Q4LDE5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SVEP1Q4LDE5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SVEP1Q4LDE5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SVEP1Q4LDE5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SVEP1Q4LDE5 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SVEP1Q4LDE5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SVEP1Q4LDE5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SVEP1Q4LDE5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SVEP1Q4LDE5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SVEP1Q4LDE5 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SVEP1Q4LDE5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SVEP1Q4LDE5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SVEP1Q4LDE5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SVEP1Q4LDE5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SVEP1Q4LDE5 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SVEP1Q4LDE5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SVEP1Q4LDE5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SVEP1Q4LDE5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SVEP1Q4LDE5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SVEP1Q4LDE5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SVEP1Q4LDE5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SVEP1Q4LDE5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SVEP1Q4LDE5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SVEP1Q4LDE5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SVEP1Q4LDE5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SVEP1Q4LDE5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SVEP1Q4LDE5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SVEP1Q4LDE5 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SVEP1Q4LDE5 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SVEP1Q4LDE5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SVEP1Q4LDE5 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SVEP1Q4LDE5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SVEP1Q4LDE5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SVEP1Q4LDE5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SVEP1Q4LDE5 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SVEP1Q4LDE5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SVEP1Q4LDE5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SVEP1Q4LDE5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SVEP1Q4LDE5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SVEP1Q4LDE5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SVEP1Q4LDE5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SVEP1Q4LDE5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SVEP1Q4LDE5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SVEP1Q4LDE5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SVEP1Q4LDE5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SVEP1Q4LDE5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SVEP1Q4LDE5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SVEP1Q4LDE5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SVEP1Q4LDE5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SVEP1Q4LDE5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SVEP1Q4LDE5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SVEP1Q4LDE5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SVEP1Q4LDE5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SVEP1Q4LDE5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SVEP1Q4LDE5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SVEP1Q4LDE5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SVEP1Q4LDE5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SVEP1Q4LDE5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SVEP1Q4LDE5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SVEP1Q4LDE5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SVEP1Q4LDE5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms