Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI83

KRTAP24-1, Keratin-associated protein 24-1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP24-1Q3LI83 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRTAP24-1Q3LI83 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRTAP24-1Q3LI83 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRTAP24-1Q3LI83 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRTAP24-1Q3LI83 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRTAP24-1Q3LI83 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRTAP24-1Q3LI83 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRTAP24-1Q3LI83 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KRTAP24-1Q3LI83 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRTAP24-1Q3LI83 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRTAP24-1Q3LI83 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRTAP24-1Q3LI83 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KRTAP24-1Q3LI83 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRTAP24-1Q3LI83 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRTAP24-1Q3LI83 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRTAP24-1Q3LI83 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRTAP24-1Q3LI83 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRTAP24-1Q3LI83 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRTAP24-1Q3LI83 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRTAP24-1Q3LI83 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KRTAP24-1Q3LI83 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRTAP24-1Q3LI83 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRTAP24-1Q3LI83 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRTAP24-1Q3LI83 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KRTAP24-1Q3LI83 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRTAP24-1Q3LI83 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRTAP24-1Q3LI83 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRTAP24-1Q3LI83 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRTAP24-1Q3LI83 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRTAP24-1Q3LI83 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRTAP24-1Q3LI83 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KRTAP24-1Q3LI83 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRTAP24-1Q3LI83 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRTAP24-1Q3LI83 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRTAP24-1Q3LI83 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRTAP24-1Q3LI83 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRTAP24-1Q3LI83 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KRTAP24-1Q3LI83 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRTAP24-1Q3LI83 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRTAP24-1Q3LI83 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRTAP24-1Q3LI83 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRTAP24-1Q3LI83 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRTAP24-1Q3LI83 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRTAP24-1Q3LI83 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRTAP24-1Q3LI83 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRTAP24-1Q3LI83 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KRTAP24-1Q3LI83 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRTAP24-1Q3LI83 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRTAP24-1Q3LI83 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KRTAP24-1Q3LI83 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRTAP24-1Q3LI83 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRTAP24-1Q3LI83 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRTAP24-1Q3LI83 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRTAP24-1Q3LI83 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRTAP24-1Q3LI83 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRTAP24-1Q3LI83 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRTAP24-1Q3LI83 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRTAP24-1Q3LI83 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRTAP24-1Q3LI83 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRTAP24-1Q3LI83 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRTAP24-1Q3LI83 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRTAP24-1Q3LI83 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRTAP24-1Q3LI83 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRTAP24-1Q3LI83 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRTAP24-1Q3LI83 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRTAP24-1Q3LI83 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRTAP24-1Q3LI83 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRTAP24-1Q3LI83 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRTAP24-1Q3LI83 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRTAP24-1Q3LI83 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRTAP24-1Q3LI83 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRTAP24-1Q3LI83 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRTAP24-1Q3LI83 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRTAP24-1Q3LI83 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KRTAP24-1Q3LI83 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRTAP24-1Q3LI83 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRTAP24-1Q3LI83 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRTAP24-1Q3LI83 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRTAP24-1Q3LI83 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRTAP24-1Q3LI83 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRTAP24-1Q3LI83 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRTAP24-1Q3LI83 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRTAP24-1Q3LI83 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRTAP24-1Q3LI83 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRTAP24-1Q3LI83 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRTAP24-1Q3LI83 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRTAP24-1Q3LI83 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRTAP24-1Q3LI83 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRTAP24-1Q3LI83 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRTAP24-1Q3LI83 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRTAP24-1Q3LI83 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRTAP24-1Q3LI83 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KRTAP24-1Q3LI83 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRTAP24-1Q3LI83 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KRTAP24-1Q3LI83 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRTAP24-1Q3LI83 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRTAP24-1Q3LI83 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRTAP24-1Q3LI83 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRTAP24-1Q3LI83 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRTAP24-1Q3LI83 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms