Protein–RNA interactions for Protein: Q2TB90

HKDC1, Putative hexokinase HKDC1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKDC1Q2TB90 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HKDC1Q2TB90 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HKDC1Q2TB90 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HKDC1Q2TB90 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HKDC1Q2TB90 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HKDC1Q2TB90 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HKDC1Q2TB90 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HKDC1Q2TB90 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HKDC1Q2TB90 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HKDC1Q2TB90 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HKDC1Q2TB90 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HKDC1Q2TB90 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HKDC1Q2TB90 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HKDC1Q2TB90 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HKDC1Q2TB90 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HKDC1Q2TB90 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HKDC1Q2TB90 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HKDC1Q2TB90 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HKDC1Q2TB90 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HKDC1Q2TB90 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HKDC1Q2TB90 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HKDC1Q2TB90 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HKDC1Q2TB90 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HKDC1Q2TB90 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HKDC1Q2TB90 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
HKDC1Q2TB90 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HKDC1Q2TB90 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HKDC1Q2TB90 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HKDC1Q2TB90 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HKDC1Q2TB90 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HKDC1Q2TB90 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HKDC1Q2TB90 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HKDC1Q2TB90 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HKDC1Q2TB90 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HKDC1Q2TB90 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HKDC1Q2TB90 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HKDC1Q2TB90 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HKDC1Q2TB90 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
HKDC1Q2TB90 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HKDC1Q2TB90 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
HKDC1Q2TB90 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HKDC1Q2TB90 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HKDC1Q2TB90 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HKDC1Q2TB90 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HKDC1Q2TB90 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HKDC1Q2TB90 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HKDC1Q2TB90 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HKDC1Q2TB90 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HKDC1Q2TB90 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HKDC1Q2TB90 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HKDC1Q2TB90 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HKDC1Q2TB90 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HKDC1Q2TB90 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HKDC1Q2TB90 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HKDC1Q2TB90 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HKDC1Q2TB90 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HKDC1Q2TB90 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HKDC1Q2TB90 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HKDC1Q2TB90 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HKDC1Q2TB90 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HKDC1Q2TB90 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HKDC1Q2TB90 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HKDC1Q2TB90 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
HKDC1Q2TB90 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HKDC1Q2TB90 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HKDC1Q2TB90 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HKDC1Q2TB90 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
HKDC1Q2TB90 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HKDC1Q2TB90 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HKDC1Q2TB90 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HKDC1Q2TB90 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HKDC1Q2TB90 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HKDC1Q2TB90 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HKDC1Q2TB90 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HKDC1Q2TB90 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HKDC1Q2TB90 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HKDC1Q2TB90 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HKDC1Q2TB90 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HKDC1Q2TB90 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HKDC1Q2TB90 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HKDC1Q2TB90 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HKDC1Q2TB90 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HKDC1Q2TB90 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HKDC1Q2TB90 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HKDC1Q2TB90 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HKDC1Q2TB90 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HKDC1Q2TB90 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HKDC1Q2TB90 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HKDC1Q2TB90 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HKDC1Q2TB90 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HKDC1Q2TB90 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
HKDC1Q2TB90 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HKDC1Q2TB90 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
HKDC1Q2TB90 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
HKDC1Q2TB90 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HKDC1Q2TB90 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HKDC1Q2TB90 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HKDC1Q2TB90 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HKDC1Q2TB90 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
HKDC1Q2TB90 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms