Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SKIDA1Q1XH10 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SKIDA1Q1XH10 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SKIDA1Q1XH10 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SKIDA1Q1XH10 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SKIDA1Q1XH10 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SKIDA1Q1XH10 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SKIDA1Q1XH10 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SKIDA1Q1XH10 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SKIDA1Q1XH10 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SKIDA1Q1XH10 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SKIDA1Q1XH10 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SKIDA1Q1XH10 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SKIDA1Q1XH10 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SKIDA1Q1XH10 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SKIDA1Q1XH10 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SKIDA1Q1XH10 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SKIDA1Q1XH10 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SKIDA1Q1XH10 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SKIDA1Q1XH10 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SKIDA1Q1XH10 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SKIDA1Q1XH10 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SKIDA1Q1XH10 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SKIDA1Q1XH10 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SKIDA1Q1XH10 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SKIDA1Q1XH10 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SKIDA1Q1XH10 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SKIDA1Q1XH10 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SKIDA1Q1XH10 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SKIDA1Q1XH10 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SKIDA1Q1XH10 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SKIDA1Q1XH10 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SKIDA1Q1XH10 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SKIDA1Q1XH10 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SKIDA1Q1XH10 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SKIDA1Q1XH10 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SKIDA1Q1XH10 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SKIDA1Q1XH10 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SKIDA1Q1XH10 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SKIDA1Q1XH10 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SKIDA1Q1XH10 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SKIDA1Q1XH10 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SKIDA1Q1XH10 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SKIDA1Q1XH10 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SKIDA1Q1XH10 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SKIDA1Q1XH10 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SKIDA1Q1XH10 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SKIDA1Q1XH10 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SKIDA1Q1XH10 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SKIDA1Q1XH10 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SKIDA1Q1XH10 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SKIDA1Q1XH10 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SKIDA1Q1XH10 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SKIDA1Q1XH10 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SKIDA1Q1XH10 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SKIDA1Q1XH10 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
SKIDA1Q1XH10 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SKIDA1Q1XH10 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SKIDA1Q1XH10 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SKIDA1Q1XH10 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SKIDA1Q1XH10 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SKIDA1Q1XH10 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SKIDA1Q1XH10 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SKIDA1Q1XH10 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SKIDA1Q1XH10 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SKIDA1Q1XH10 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
SKIDA1Q1XH10 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SKIDA1Q1XH10 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SKIDA1Q1XH10 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SKIDA1Q1XH10 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SKIDA1Q1XH10 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SKIDA1Q1XH10 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SKIDA1Q1XH10 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SKIDA1Q1XH10 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SKIDA1Q1XH10 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SKIDA1Q1XH10 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SKIDA1Q1XH10 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SKIDA1Q1XH10 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SKIDA1Q1XH10 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SKIDA1Q1XH10 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SKIDA1Q1XH10 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SKIDA1Q1XH10 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SKIDA1Q1XH10 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SKIDA1Q1XH10 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SKIDA1Q1XH10 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SKIDA1Q1XH10 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SKIDA1Q1XH10 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SKIDA1Q1XH10 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SKIDA1Q1XH10 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SKIDA1Q1XH10 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SKIDA1Q1XH10 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SKIDA1Q1XH10 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SKIDA1Q1XH10 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SKIDA1Q1XH10 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SKIDA1Q1XH10 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SKIDA1Q1XH10 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SKIDA1Q1XH10 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SKIDA1Q1XH10 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SKIDA1Q1XH10 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SKIDA1Q1XH10 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms