Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SGCBQ16585 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SGCBQ16585 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SGCBQ16585 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SGCBQ16585 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SGCBQ16585 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SGCBQ16585 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SGCBQ16585 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SGCBQ16585 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SGCBQ16585 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SGCBQ16585 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SGCBQ16585 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SGCBQ16585 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SGCBQ16585 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SGCBQ16585 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SGCBQ16585 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SGCBQ16585 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SGCBQ16585 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SGCBQ16585 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SGCBQ16585 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SGCBQ16585 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SGCBQ16585 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SGCBQ16585 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SGCBQ16585 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SGCBQ16585 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SGCBQ16585 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SGCBQ16585 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SGCBQ16585 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SGCBQ16585 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SGCBQ16585 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SGCBQ16585 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SGCBQ16585 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SGCBQ16585 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SGCBQ16585 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SGCBQ16585 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SGCBQ16585 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SGCBQ16585 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SGCBQ16585 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SGCBQ16585 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SGCBQ16585 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SGCBQ16585 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SGCBQ16585 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SGCBQ16585 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SGCBQ16585 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SGCBQ16585 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SGCBQ16585 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SGCBQ16585 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SGCBQ16585 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SGCBQ16585 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SGCBQ16585 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SGCBQ16585 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SGCBQ16585 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SGCBQ16585 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SGCBQ16585 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SGCBQ16585 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SGCBQ16585 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SGCBQ16585 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SGCBQ16585 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SGCBQ16585 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SGCBQ16585 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SGCBQ16585 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SGCBQ16585 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SGCBQ16585 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SGCBQ16585 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SGCBQ16585 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SGCBQ16585 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SGCBQ16585 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SGCBQ16585 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SGCBQ16585 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SGCBQ16585 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SGCBQ16585 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SGCBQ16585 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SGCBQ16585 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SGCBQ16585 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SGCBQ16585 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SGCBQ16585 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SGCBQ16585 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SGCBQ16585 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SGCBQ16585 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SGCBQ16585 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SGCBQ16585 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SGCBQ16585 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SGCBQ16585 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SGCBQ16585 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SGCBQ16585 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SGCBQ16585 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SGCBQ16585 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SGCBQ16585 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SGCBQ16585 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SGCBQ16585 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SGCBQ16585 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SGCBQ16585 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SGCBQ16585 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SGCBQ16585 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SGCBQ16585 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SGCBQ16585 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SGCBQ16585 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SGCBQ16585 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SGCBQ16585 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SGCBQ16585 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
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