Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TWIST1Q15672 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TWIST1Q15672 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TWIST1Q15672 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TWIST1Q15672 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TWIST1Q15672 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TWIST1Q15672 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TWIST1Q15672 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TWIST1Q15672 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TWIST1Q15672 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TWIST1Q15672 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TWIST1Q15672 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TWIST1Q15672 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TWIST1Q15672 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TWIST1Q15672 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TWIST1Q15672 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TWIST1Q15672 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TWIST1Q15672 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TWIST1Q15672 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TWIST1Q15672 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TWIST1Q15672 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TWIST1Q15672 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TWIST1Q15672 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TWIST1Q15672 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TWIST1Q15672 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TWIST1Q15672 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TWIST1Q15672 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TWIST1Q15672 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TWIST1Q15672 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TWIST1Q15672 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TWIST1Q15672 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TWIST1Q15672 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TWIST1Q15672 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TWIST1Q15672 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TWIST1Q15672 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TWIST1Q15672 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TWIST1Q15672 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TWIST1Q15672 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TWIST1Q15672 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TWIST1Q15672 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TWIST1Q15672 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TWIST1Q15672 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TWIST1Q15672 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TWIST1Q15672 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TWIST1Q15672 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TWIST1Q15672 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TWIST1Q15672 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TWIST1Q15672 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TWIST1Q15672 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TWIST1Q15672 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TWIST1Q15672 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TWIST1Q15672 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TWIST1Q15672 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TWIST1Q15672 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TWIST1Q15672 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TWIST1Q15672 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TWIST1Q15672 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TWIST1Q15672 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TWIST1Q15672 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TWIST1Q15672 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TWIST1Q15672 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TWIST1Q15672 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TWIST1Q15672 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TWIST1Q15672 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TWIST1Q15672 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TWIST1Q15672 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TWIST1Q15672 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TWIST1Q15672 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TWIST1Q15672 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TWIST1Q15672 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TWIST1Q15672 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TWIST1Q15672 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TWIST1Q15672 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TWIST1Q15672 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TWIST1Q15672 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TWIST1Q15672 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TWIST1Q15672 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TWIST1Q15672 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TWIST1Q15672 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TWIST1Q15672 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TWIST1Q15672 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TWIST1Q15672 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TWIST1Q15672 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TWIST1Q15672 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TWIST1Q15672 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TWIST1Q15672 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TWIST1Q15672 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TWIST1Q15672 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TWIST1Q15672 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TWIST1Q15672 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TWIST1Q15672 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TWIST1Q15672 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TWIST1Q15672 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TWIST1Q15672 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TWIST1Q15672 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TWIST1Q15672 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TWIST1Q15672 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TWIST1Q15672 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TWIST1Q15672 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TWIST1Q15672 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.3 ms