Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMGN3Q15651 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMGN3Q15651 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMGN3Q15651 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMGN3Q15651 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMGN3Q15651 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMGN3Q15651 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HMGN3Q15651 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMGN3Q15651 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMGN3Q15651 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMGN3Q15651 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HMGN3Q15651 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HMGN3Q15651 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HMGN3Q15651 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMGN3Q15651 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMGN3Q15651 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMGN3Q15651 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMGN3Q15651 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMGN3Q15651 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMGN3Q15651 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HMGN3Q15651 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMGN3Q15651 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMGN3Q15651 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMGN3Q15651 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMGN3Q15651 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMGN3Q15651 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMGN3Q15651 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMGN3Q15651 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMGN3Q15651 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMGN3Q15651 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMGN3Q15651 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMGN3Q15651 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMGN3Q15651 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMGN3Q15651 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HMGN3Q15651 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HMGN3Q15651 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMGN3Q15651 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMGN3Q15651 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMGN3Q15651 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMGN3Q15651 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMGN3Q15651 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMGN3Q15651 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMGN3Q15651 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMGN3Q15651 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMGN3Q15651 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMGN3Q15651 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMGN3Q15651 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMGN3Q15651 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMGN3Q15651 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMGN3Q15651 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMGN3Q15651 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMGN3Q15651 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMGN3Q15651 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMGN3Q15651 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HMGN3Q15651 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMGN3Q15651 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMGN3Q15651 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMGN3Q15651 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGN3Q15651 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGN3Q15651 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGN3Q15651 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGN3Q15651 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGN3Q15651 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGN3Q15651 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMGN3Q15651 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HMGN3Q15651 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGN3Q15651 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMGN3Q15651 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMGN3Q15651 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGN3Q15651 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGN3Q15651 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGN3Q15651 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMGN3Q15651 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGN3Q15651 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGN3Q15651 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGN3Q15651 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGN3Q15651 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMGN3Q15651 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMGN3Q15651 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMGN3Q15651 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMGN3Q15651 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMGN3Q15651 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMGN3Q15651 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HMGN3Q15651 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGN3Q15651 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGN3Q15651 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGN3Q15651 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGN3Q15651 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMGN3Q15651 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMGN3Q15651 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMGN3Q15651 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMGN3Q15651 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGN3Q15651 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGN3Q15651 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGN3Q15651 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMGN3Q15651 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
HMGN3Q15651 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGN3Q15651 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGN3Q15651 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGN3Q15651 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
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