Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.26■■■■■ 5
EEA1Q15075 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.26■■■■■ 5
EEA1Q15075 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.22■■■■■ 4.99
EEA1Q15075 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC46.21■■■■■ 4.99
EEA1Q15075 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC46.2■■■■■ 4.99
EEA1Q15075 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC46.2■■■■■ 4.99
EEA1Q15075 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.2■■■■■ 4.99
EEA1Q15075 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC46.19■■■■■ 4.99
EEA1Q15075 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC46.16■■■■■ 4.98
EEA1Q15075 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC46.16■■■■■ 4.98
EEA1Q15075 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC46.16■■■■■ 4.98
EEA1Q15075 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC46.13■■■■■ 4.98
EEA1Q15075 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC46.1■■■■■ 4.97
EEA1Q15075 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.05■■■■■ 4.96
EEA1Q15075 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC46.05■■■■■ 4.96
EEA1Q15075 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.05■■■■■ 4.96
EEA1Q15075 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.03■■■■■ 4.96
EEA1Q15075 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC46.03■■■■■ 4.96
EEA1Q15075 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC46.02■■■■■ 4.96
EEA1Q15075 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC46■■■■■ 4.95
EEA1Q15075 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.99■■■■■ 4.95
EEA1Q15075 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC45.98■■■■■ 4.95
EEA1Q15075 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC45.96■■■■■ 4.95
EEA1Q15075 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.95■■■■■ 4.95
EEA1Q15075 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC45.94■■■■■ 4.94
EEA1Q15075 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.92■■■■■ 4.94
EEA1Q15075 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.91■■■■■ 4.94
EEA1Q15075 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC45.89■■■■■ 4.94
EEA1Q15075 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC45.89■■■■■ 4.94
EEA1Q15075 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.88■■■■■ 4.94
EEA1Q15075 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.87■■■■■ 4.93
EEA1Q15075 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.86■■■■■ 4.93
EEA1Q15075 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.84■■■■■ 4.93
EEA1Q15075 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.82■■■■■ 4.93
EEA1Q15075 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC45.82■■■■■ 4.93
EEA1Q15075 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC45.8■■■■■ 4.92
EEA1Q15075 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC45.8■■■■■ 4.92
EEA1Q15075 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.76■■■■■ 4.92
EEA1Q15075 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.75■■■■■ 4.91
EEA1Q15075 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC45.74■■■■■ 4.91
EEA1Q15075 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC45.71■■■■■ 4.91
EEA1Q15075 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC45.7■■■■■ 4.91
EEA1Q15075 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC45.68■■■■■ 4.9
EEA1Q15075 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.67■■■■■ 4.9
EEA1Q15075 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC45.66■■■■■ 4.9
EEA1Q15075 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.64■■■■■ 4.9
EEA1Q15075 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC45.61■■■■■ 4.89
EEA1Q15075 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.6■■■■■ 4.89
EEA1Q15075 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.59■■■■■ 4.89
EEA1Q15075 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.57■■■■■ 4.88
EEA1Q15075 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.56■■■■■ 4.88
EEA1Q15075 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC45.56■■■■■ 4.88
EEA1Q15075 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC45.55■■■■■ 4.88
EEA1Q15075 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
EEA1Q15075 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC45.54■■■■■ 4.88
EEA1Q15075 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC45.53■■■■■ 4.88
EEA1Q15075 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC45.53■■■■■ 4.88
EEA1Q15075 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.5■■■■■ 4.87
EEA1Q15075 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC45.5■■■■■ 4.87
EEA1Q15075 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC45.5■■■■■ 4.87
EEA1Q15075 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.49■■■■■ 4.87
EEA1Q15075 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC45.48■■■■■ 4.87
EEA1Q15075 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.47■■■■■ 4.87
EEA1Q15075 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.47■■■■■ 4.87
EEA1Q15075 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.44■■■■■ 4.87
EEA1Q15075 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.44■■■■■ 4.87
EEA1Q15075 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC45.43■■■■■ 4.86
EEA1Q15075 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC45.43■■■■■ 4.86
EEA1Q15075 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.43■■■■■ 4.86
EEA1Q15075 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC45.42■■■■■ 4.86
EEA1Q15075 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC45.42■■■■■ 4.86
EEA1Q15075 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.41■■■■■ 4.86
EEA1Q15075 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC45.39■■■■■ 4.86
EEA1Q15075 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC45.38■■■■■ 4.86
EEA1Q15075 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.35■■■■■ 4.85
EEA1Q15075 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC45.34■■■■■ 4.85
EEA1Q15075 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC45.33■■■■■ 4.85
EEA1Q15075 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.33■■■■■ 4.85
EEA1Q15075 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC45.32■■■■■ 4.85
EEA1Q15075 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.31■■■■■ 4.84
EEA1Q15075 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC45.31■■■■■ 4.84
EEA1Q15075 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC45.31■■■■■ 4.84
EEA1Q15075 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.31■■■■■ 4.84
EEA1Q15075 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.3■■■■■ 4.84
EEA1Q15075 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC45.3■■■■■ 4.84
EEA1Q15075 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC45.29■■■■■ 4.84
EEA1Q15075 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.27■■■■■ 4.84
EEA1Q15075 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC45.27■■■■■ 4.84
EEA1Q15075 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.27■■■■■ 4.84
EEA1Q15075 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC45.27■■■■■ 4.84
EEA1Q15075 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.26■■■■■ 4.84
EEA1Q15075 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.26■■■■■ 4.84
EEA1Q15075 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.25■■■■■ 4.83
EEA1Q15075 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.25■■■■■ 4.83
EEA1Q15075 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC45.19■■■■■ 4.82
EEA1Q15075 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
EEA1Q15075 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.15■■■■■ 4.82
EEA1Q15075 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.14■■■■■ 4.82
EEA1Q15075 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC45.13■■■■■ 4.82
EEA1Q15075 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC45.12■■■■■ 4.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.2 ms