Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
ARHGEF6Q15052 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
ARHGEF6Q15052 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
ARHGEF6Q15052 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
ARHGEF6Q15052 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
ARHGEF6Q15052 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
ARHGEF6Q15052 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
ARHGEF6Q15052 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
ARHGEF6Q15052 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
ARHGEF6Q15052 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
ARHGEF6Q15052 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
ARHGEF6Q15052 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
ARHGEF6Q15052 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
ARHGEF6Q15052 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
ARHGEF6Q15052 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
ARHGEF6Q15052 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
ARHGEF6Q15052 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
ARHGEF6Q15052 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
ARHGEF6Q15052 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
ARHGEF6Q15052 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
ARHGEF6Q15052 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
ARHGEF6Q15052 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
ARHGEF6Q15052 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ARHGEF6Q15052 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
ARHGEF6Q15052 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
ARHGEF6Q15052 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
ARHGEF6Q15052 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
ARHGEF6Q15052 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
ARHGEF6Q15052 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ARHGEF6Q15052 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
ARHGEF6Q15052 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
ARHGEF6Q15052 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
ARHGEF6Q15052 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ARHGEF6Q15052 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
ARHGEF6Q15052 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
ARHGEF6Q15052 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
ARHGEF6Q15052 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
ARHGEF6Q15052 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
ARHGEF6Q15052 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
ARHGEF6Q15052 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ARHGEF6Q15052 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
ARHGEF6Q15052 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
ARHGEF6Q15052 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
ARHGEF6Q15052 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
ARHGEF6Q15052 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
ARHGEF6Q15052 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ARHGEF6Q15052 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
ARHGEF6Q15052 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
ARHGEF6Q15052 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
ARHGEF6Q15052 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
ARHGEF6Q15052 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
ARHGEF6Q15052 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
ARHGEF6Q15052 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
ARHGEF6Q15052 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ARHGEF6Q15052 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
ARHGEF6Q15052 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
ARHGEF6Q15052 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ARHGEF6Q15052 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ARHGEF6Q15052 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ARHGEF6Q15052 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ARHGEF6Q15052 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ARHGEF6Q15052 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
ARHGEF6Q15052 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ARHGEF6Q15052 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ARHGEF6Q15052 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ARHGEF6Q15052 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
ARHGEF6Q15052 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ARHGEF6Q15052 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ARHGEF6Q15052 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ARHGEF6Q15052 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ARHGEF6Q15052 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ARHGEF6Q15052 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ARHGEF6Q15052 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ARHGEF6Q15052 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
ARHGEF6Q15052 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
ARHGEF6Q15052 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
ARHGEF6Q15052 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
ARHGEF6Q15052 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
ARHGEF6Q15052 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.93■■■□□ 2.7
ARHGEF6Q15052 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
ARHGEF6Q15052 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
ARHGEF6Q15052 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
ARHGEF6Q15052 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
ARHGEF6Q15052 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
ARHGEF6Q15052 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
ARHGEF6Q15052 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC31.88■■■□□ 2.69
ARHGEF6Q15052 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
ARHGEF6Q15052 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
ARHGEF6Q15052 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
ARHGEF6Q15052 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
ARHGEF6Q15052 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
ARHGEF6Q15052 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
ARHGEF6Q15052 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
ARHGEF6Q15052 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
ARHGEF6Q15052 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
ARHGEF6Q15052 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
ARHGEF6Q15052 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
ARHGEF6Q15052 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC31.76■■■□□ 2.67
ARHGEF6Q15052 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
ARHGEF6Q15052 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
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