Protein–RNA interactions for Protein: Q15021

NCAPD2, Condensin complex subunit 1, humanhuman

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Length 1,401 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD2Q15021 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
NCAPD2Q15021 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
NCAPD2Q15021 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
NCAPD2Q15021 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
NCAPD2Q15021 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
NCAPD2Q15021 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
NCAPD2Q15021 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
NCAPD2Q15021 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
NCAPD2Q15021 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
NCAPD2Q15021 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.55
NCAPD2Q15021 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
NCAPD2Q15021 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
NCAPD2Q15021 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
NCAPD2Q15021 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
NCAPD2Q15021 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
NCAPD2Q15021 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
NCAPD2Q15021 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
NCAPD2Q15021 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
NCAPD2Q15021 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
NCAPD2Q15021 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
NCAPD2Q15021 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
NCAPD2Q15021 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
NCAPD2Q15021 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
NCAPD2Q15021 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
NCAPD2Q15021 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC37.1■■■■□ 3.53
NCAPD2Q15021 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
NCAPD2Q15021 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
NCAPD2Q15021 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
NCAPD2Q15021 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
NCAPD2Q15021 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
NCAPD2Q15021 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
NCAPD2Q15021 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
NCAPD2Q15021 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
NCAPD2Q15021 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
NCAPD2Q15021 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
NCAPD2Q15021 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC36.96■■■■□ 3.51
NCAPD2Q15021 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
NCAPD2Q15021 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
NCAPD2Q15021 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
NCAPD2Q15021 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
NCAPD2Q15021 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC36.94■■■■□ 3.5
NCAPD2Q15021 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC36.89■■■■□ 3.5
NCAPD2Q15021 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
NCAPD2Q15021 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
NCAPD2Q15021 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
NCAPD2Q15021 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
NCAPD2Q15021 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
NCAPD2Q15021 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
NCAPD2Q15021 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
NCAPD2Q15021 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
NCAPD2Q15021 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
NCAPD2Q15021 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
NCAPD2Q15021 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
NCAPD2Q15021 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
NCAPD2Q15021 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.47
NCAPD2Q15021 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC36.73■■■■□ 3.47
NCAPD2Q15021 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC36.73■■■■□ 3.47
NCAPD2Q15021 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
NCAPD2Q15021 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
NCAPD2Q15021 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.46
NCAPD2Q15021 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
NCAPD2Q15021 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
NCAPD2Q15021 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
NCAPD2Q15021 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
NCAPD2Q15021 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
NCAPD2Q15021 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
NCAPD2Q15021 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
NCAPD2Q15021 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC36.63■■■■□ 3.46
NCAPD2Q15021 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
NCAPD2Q15021 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
NCAPD2Q15021 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
NCAPD2Q15021 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
NCAPD2Q15021 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
NCAPD2Q15021 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
NCAPD2Q15021 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
NCAPD2Q15021 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
NCAPD2Q15021 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
NCAPD2Q15021 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
NCAPD2Q15021 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
NCAPD2Q15021 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
NCAPD2Q15021 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
NCAPD2Q15021 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
NCAPD2Q15021 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
NCAPD2Q15021 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
NCAPD2Q15021 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
NCAPD2Q15021 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
NCAPD2Q15021 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
NCAPD2Q15021 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC36.46■■■■□ 3.43
NCAPD2Q15021 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
NCAPD2Q15021 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
NCAPD2Q15021 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
NCAPD2Q15021 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
NCAPD2Q15021 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
NCAPD2Q15021 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
NCAPD2Q15021 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
NCAPD2Q15021 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
NCAPD2Q15021 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
NCAPD2Q15021 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
NCAPD2Q15021 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
NCAPD2Q15021 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
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