Protein–RNA interactions for Protein: Q13573

SNW1, SNW domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNW1Q13573 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SNW1Q13573 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
SNW1Q13573 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
SNW1Q13573 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
SNW1Q13573 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
SNW1Q13573 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
SNW1Q13573 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
SNW1Q13573 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
SNW1Q13573 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
SNW1Q13573 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
SNW1Q13573 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SNW1Q13573 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SNW1Q13573 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
SNW1Q13573 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
SNW1Q13573 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SNW1Q13573 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
SNW1Q13573 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SNW1Q13573 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SNW1Q13573 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SNW1Q13573 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SNW1Q13573 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SNW1Q13573 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SNW1Q13573 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SNW1Q13573 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SNW1Q13573 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
SNW1Q13573 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SNW1Q13573 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
SNW1Q13573 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
SNW1Q13573 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
SNW1Q13573 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
SNW1Q13573 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
SNW1Q13573 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
SNW1Q13573 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
SNW1Q13573 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
SNW1Q13573 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
SNW1Q13573 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
SNW1Q13573 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
SNW1Q13573 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
SNW1Q13573 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
SNW1Q13573 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
SNW1Q13573 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SNW1Q13573 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
SNW1Q13573 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
SNW1Q13573 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
SNW1Q13573 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
SNW1Q13573 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
SNW1Q13573 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC31.3■■■□□ 2.6
SNW1Q13573 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SNW1Q13573 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SNW1Q13573 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
SNW1Q13573 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
SNW1Q13573 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
SNW1Q13573 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SNW1Q13573 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SNW1Q13573 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SNW1Q13573 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SNW1Q13573 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SNW1Q13573 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SNW1Q13573 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SNW1Q13573 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SNW1Q13573 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SNW1Q13573 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SNW1Q13573 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
SNW1Q13573 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SNW1Q13573 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
SNW1Q13573 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SNW1Q13573 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SNW1Q13573 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
SNW1Q13573 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
SNW1Q13573 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
SNW1Q13573 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
SNW1Q13573 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
SNW1Q13573 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
SNW1Q13573 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
SNW1Q13573 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
SNW1Q13573 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SNW1Q13573 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
SNW1Q13573 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
SNW1Q13573 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
SNW1Q13573 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
SNW1Q13573 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
SNW1Q13573 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SNW1Q13573 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SNW1Q13573 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
SNW1Q13573 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SNW1Q13573 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SNW1Q13573 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SNW1Q13573 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
SNW1Q13573 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
SNW1Q13573 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SNW1Q13573 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SNW1Q13573 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
SNW1Q13573 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SNW1Q13573 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SNW1Q13573 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SNW1Q13573 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SNW1Q13573 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SNW1Q13573 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
SNW1Q13573 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
SNW1Q13573 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
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