Protein–RNA interactions for Protein: Q12766

HMGXB3, HMG domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB3Q12766 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.23■■■■■ 5.79
HMGXB3Q12766 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.22■■■■■ 5.79
HMGXB3Q12766 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC51.21■■■■■ 5.79
HMGXB3Q12766 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC51.2■■■■■ 5.79
HMGXB3Q12766 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC51.19■■■■■ 5.79
HMGXB3Q12766 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC51.18■■■■■ 5.78
HMGXB3Q12766 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC51.17■■■■■ 5.78
HMGXB3Q12766 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC51.08■■■■■ 5.77
HMGXB3Q12766 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC51.08■■■■■ 5.77
HMGXB3Q12766 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.06■■■■■ 5.76
HMGXB3Q12766 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC51.05■■■■■ 5.76
HMGXB3Q12766 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.04■■■■■ 5.76
HMGXB3Q12766 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.03■■■■■ 5.76
HMGXB3Q12766 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC51.03■■■■■ 5.76
HMGXB3Q12766 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC51.03■■■■■ 5.76
HMGXB3Q12766 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC51■■■■■ 5.75
HMGXB3Q12766 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC50.99■■■■■ 5.75
HMGXB3Q12766 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC50.99■■■■■ 5.75
HMGXB3Q12766 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC50.99■■■■■ 5.75
HMGXB3Q12766 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC50.99■■■■■ 5.75
HMGXB3Q12766 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC50.96■■■■■ 5.75
HMGXB3Q12766 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC50.94■■■■■ 5.75
HMGXB3Q12766 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.9■■■■■ 5.74
HMGXB3Q12766 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC50.89■■■■■ 5.74
HMGXB3Q12766 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC50.89■■■■■ 5.74
HMGXB3Q12766 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC50.88■■■■■ 5.74
HMGXB3Q12766 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC50.86■■■■■ 5.73
HMGXB3Q12766 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC50.82■■■■■ 5.73
HMGXB3Q12766 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC50.82■■■■■ 5.73
HMGXB3Q12766 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC50.78■■■■■ 5.72
HMGXB3Q12766 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC50.77■■■■■ 5.72
HMGXB3Q12766 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC50.77■■■■■ 5.72
HMGXB3Q12766 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC50.77■■■■■ 5.72
HMGXB3Q12766 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC50.76■■■■■ 5.72
HMGXB3Q12766 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.74■■■■■ 5.71
HMGXB3Q12766 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC50.73■■■■■ 5.71
HMGXB3Q12766 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC50.67■■■■■ 5.7
HMGXB3Q12766 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC50.65■■■■■ 5.7
HMGXB3Q12766 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.63■■■■■ 5.7
HMGXB3Q12766 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.58■■■■■ 5.69
HMGXB3Q12766 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC50.57■■■■■ 5.69
HMGXB3Q12766 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC50.57■■■■■ 5.69
HMGXB3Q12766 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.57■■■■■ 5.69
HMGXB3Q12766 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC50.56■■■■■ 5.68
HMGXB3Q12766 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC50.56■■■■■ 5.68
HMGXB3Q12766 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.55■■■■■ 5.68
HMGXB3Q12766 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC50.55■■■■■ 5.68
HMGXB3Q12766 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC50.54■■■■■ 5.68
HMGXB3Q12766 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC50.52■■■■■ 5.68
HMGXB3Q12766 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC50.5■■■■■ 5.67
HMGXB3Q12766 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC50.47■■■■■ 5.67
HMGXB3Q12766 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC50.46■■■■■ 5.67
HMGXB3Q12766 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC50.46■■■■■ 5.67
HMGXB3Q12766 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC50.46■■■■■ 5.67
HMGXB3Q12766 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.45■■■■■ 5.67
HMGXB3Q12766 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC50.43■■■■■ 5.66
HMGXB3Q12766 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC50.43■■■■■ 5.66
HMGXB3Q12766 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.38■■■■■ 5.66
HMGXB3Q12766 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC50.36■■■■■ 5.65
HMGXB3Q12766 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC50.34■■■■■ 5.65
HMGXB3Q12766 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC50.3■■■■■ 5.64
HMGXB3Q12766 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC50.3■■■■■ 5.64
HMGXB3Q12766 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.29■■■■■ 5.64
HMGXB3Q12766 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC50.28■■■■■ 5.64
HMGXB3Q12766 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC50.26■■■■■ 5.64
HMGXB3Q12766 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.25■■■■■ 5.63
HMGXB3Q12766 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC50.25■■■■■ 5.63
HMGXB3Q12766 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC50.25■■■■■ 5.63
HMGXB3Q12766 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC50.22■■■■■ 5.63
HMGXB3Q12766 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC50.21■■■■■ 5.63
HMGXB3Q12766 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC50.21■■■■■ 5.63
HMGXB3Q12766 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.2■■■■■ 5.63
HMGXB3Q12766 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC50.18■■■■■ 5.62
HMGXB3Q12766 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC50.16■■■■■ 5.62
HMGXB3Q12766 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC50.16■■■■■ 5.62
HMGXB3Q12766 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.15■■■■■ 5.62
HMGXB3Q12766 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC50.15■■■■■ 5.62
HMGXB3Q12766 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.14■■■■■ 5.62
HMGXB3Q12766 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC50.11■■■■■ 5.61
HMGXB3Q12766 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.11■■■■■ 5.61
HMGXB3Q12766 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC50.06■■■■■ 5.6
HMGXB3Q12766 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC50.06■■■■■ 5.6
HMGXB3Q12766 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC50.06■■■■■ 5.6
HMGXB3Q12766 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC50.06■■■■■ 5.6
HMGXB3Q12766 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC50.04■■■■■ 5.6
HMGXB3Q12766 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC50.02■■■■■ 5.6
HMGXB3Q12766 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC50.02■■■■■ 5.6
HMGXB3Q12766 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.01■■■■■ 5.6
HMGXB3Q12766 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50■■■■■ 5.59
HMGXB3Q12766 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC50■■■■■ 5.59
HMGXB3Q12766 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.98■■■■■ 5.59
HMGXB3Q12766 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC49.94■■■■■ 5.58
HMGXB3Q12766 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.91■■■■■ 5.58
HMGXB3Q12766 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.91■■■■■ 5.58
HMGXB3Q12766 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC49.87■■■■■ 5.57
HMGXB3Q12766 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.84■■■■■ 5.57
HMGXB3Q12766 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC49.84■■■■■ 5.57
HMGXB3Q12766 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC49.83■■■■■ 5.57
HMGXB3Q12766 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC49.83■■■■■ 5.57
HMGXB3Q12766 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC49.83■■■■■ 5.57
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