Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPOCK1Q08629 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPOCK1Q08629 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPOCK1Q08629 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPOCK1Q08629 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPOCK1Q08629 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPOCK1Q08629 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPOCK1Q08629 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPOCK1Q08629 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SPOCK1Q08629 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPOCK1Q08629 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPOCK1Q08629 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPOCK1Q08629 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPOCK1Q08629 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPOCK1Q08629 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPOCK1Q08629 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPOCK1Q08629 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPOCK1Q08629 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPOCK1Q08629 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPOCK1Q08629 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPOCK1Q08629 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPOCK1Q08629 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPOCK1Q08629 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPOCK1Q08629 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPOCK1Q08629 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SPOCK1Q08629 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPOCK1Q08629 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPOCK1Q08629 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SPOCK1Q08629 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPOCK1Q08629 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPOCK1Q08629 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPOCK1Q08629 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPOCK1Q08629 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPOCK1Q08629 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPOCK1Q08629 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPOCK1Q08629 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPOCK1Q08629 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPOCK1Q08629 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPOCK1Q08629 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPOCK1Q08629 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPOCK1Q08629 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPOCK1Q08629 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPOCK1Q08629 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPOCK1Q08629 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPOCK1Q08629 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPOCK1Q08629 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPOCK1Q08629 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPOCK1Q08629 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPOCK1Q08629 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPOCK1Q08629 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPOCK1Q08629 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPOCK1Q08629 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPOCK1Q08629 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPOCK1Q08629 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SPOCK1Q08629 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPOCK1Q08629 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SPOCK1Q08629 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPOCK1Q08629 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPOCK1Q08629 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPOCK1Q08629 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPOCK1Q08629 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPOCK1Q08629 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPOCK1Q08629 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPOCK1Q08629 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPOCK1Q08629 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPOCK1Q08629 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPOCK1Q08629 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPOCK1Q08629 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPOCK1Q08629 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SPOCK1Q08629 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPOCK1Q08629 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SPOCK1Q08629 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPOCK1Q08629 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPOCK1Q08629 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPOCK1Q08629 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPOCK1Q08629 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPOCK1Q08629 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPOCK1Q08629 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPOCK1Q08629 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SPOCK1Q08629 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPOCK1Q08629 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPOCK1Q08629 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPOCK1Q08629 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPOCK1Q08629 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPOCK1Q08629 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPOCK1Q08629 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPOCK1Q08629 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPOCK1Q08629 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPOCK1Q08629 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPOCK1Q08629 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPOCK1Q08629 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPOCK1Q08629 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPOCK1Q08629 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPOCK1Q08629 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPOCK1Q08629 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPOCK1Q08629 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPOCK1Q08629 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPOCK1Q08629 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPOCK1Q08629 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPOCK1Q08629 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms