Protein–RNA interactions for Protein: Q01130

SRSF2, Serine/arginine-rich splicing factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF2Q01130 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRSF2Q01130 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SRSF2Q01130 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SRSF2Q01130 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SRSF2Q01130 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRSF2Q01130 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SRSF2Q01130 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRSF2Q01130 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRSF2Q01130 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRSF2Q01130 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRSF2Q01130 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRSF2Q01130 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRSF2Q01130 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRSF2Q01130 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRSF2Q01130 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRSF2Q01130 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRSF2Q01130 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SRSF2Q01130 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRSF2Q01130 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SRSF2Q01130 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRSF2Q01130 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRSF2Q01130 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRSF2Q01130 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRSF2Q01130 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRSF2Q01130 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRSF2Q01130 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SRSF2Q01130 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRSF2Q01130 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRSF2Q01130 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRSF2Q01130 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRSF2Q01130 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRSF2Q01130 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRSF2Q01130 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRSF2Q01130 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRSF2Q01130 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SRSF2Q01130 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SRSF2Q01130 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRSF2Q01130 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRSF2Q01130 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRSF2Q01130 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SRSF2Q01130 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRSF2Q01130 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRSF2Q01130 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRSF2Q01130 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRSF2Q01130 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRSF2Q01130 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRSF2Q01130 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRSF2Q01130 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRSF2Q01130 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRSF2Q01130 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRSF2Q01130 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRSF2Q01130 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRSF2Q01130 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRSF2Q01130 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRSF2Q01130 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRSF2Q01130 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRSF2Q01130 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRSF2Q01130 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRSF2Q01130 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRSF2Q01130 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRSF2Q01130 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRSF2Q01130 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRSF2Q01130 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SRSF2Q01130 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SRSF2Q01130 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRSF2Q01130 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRSF2Q01130 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRSF2Q01130 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRSF2Q01130 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SRSF2Q01130 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRSF2Q01130 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRSF2Q01130 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRSF2Q01130 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SRSF2Q01130 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRSF2Q01130 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRSF2Q01130 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRSF2Q01130 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRSF2Q01130 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRSF2Q01130 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRSF2Q01130 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRSF2Q01130 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRSF2Q01130 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRSF2Q01130 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRSF2Q01130 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRSF2Q01130 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRSF2Q01130 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRSF2Q01130 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRSF2Q01130 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRSF2Q01130 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRSF2Q01130 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRSF2Q01130 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRSF2Q01130 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRSF2Q01130 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRSF2Q01130 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRSF2Q01130 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRSF2Q01130 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRSF2Q01130 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRSF2Q01130 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRSF2Q01130 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRSF2Q01130 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms