Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
CRB1P82279 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
CRB1P82279 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
CRB1P82279 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
CRB1P82279 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
CRB1P82279 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
CRB1P82279 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
CRB1P82279 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.66
CRB1P82279 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.66
CRB1P82279 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC37.87■■■■□ 3.65
CRB1P82279 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
CRB1P82279 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
CRB1P82279 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
CRB1P82279 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
CRB1P82279 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.65
CRB1P82279 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
CRB1P82279 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
CRB1P82279 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
CRB1P82279 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
CRB1P82279 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
CRB1P82279 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
CRB1P82279 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
CRB1P82279 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
CRB1P82279 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC37.68■■■■□ 3.62
CRB1P82279 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
CRB1P82279 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC37.66■■■■□ 3.62
CRB1P82279 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC37.66■■■■□ 3.62
CRB1P82279 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
CRB1P82279 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
CRB1P82279 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
CRB1P82279 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
CRB1P82279 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
CRB1P82279 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
CRB1P82279 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
CRB1P82279 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
CRB1P82279 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
CRB1P82279 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
CRB1P82279 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
CRB1P82279 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
CRB1P82279 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
CRB1P82279 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
CRB1P82279 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
CRB1P82279 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
CRB1P82279 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
CRB1P82279 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC37.48■■■■□ 3.59
CRB1P82279 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
CRB1P82279 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
CRB1P82279 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
CRB1P82279 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC37.45■■■■□ 3.59
CRB1P82279 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
CRB1P82279 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
CRB1P82279 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
CRB1P82279 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
CRB1P82279 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
CRB1P82279 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC37.39■■■■□ 3.58
CRB1P82279 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.58
CRB1P82279 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC37.37■■■■□ 3.57
CRB1P82279 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
CRB1P82279 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
CRB1P82279 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC37.36■■■■□ 3.57
CRB1P82279 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
CRB1P82279 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
CRB1P82279 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC37.35■■■■□ 3.57
CRB1P82279 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
CRB1P82279 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
CRB1P82279 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.29■■■■□ 3.56
CRB1P82279 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.55
CRB1P82279 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC37.26■■■■□ 3.55
CRB1P82279 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
CRB1P82279 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
CRB1P82279 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
CRB1P82279 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
CRB1P82279 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
CRB1P82279 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.55
CRB1P82279 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
CRB1P82279 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
CRB1P82279 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC37.19■■■■□ 3.54
CRB1P82279 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
CRB1P82279 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
CRB1P82279 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
CRB1P82279 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
CRB1P82279 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
CRB1P82279 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
CRB1P82279 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
CRB1P82279 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
CRB1P82279 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
CRB1P82279 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
CRB1P82279 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
CRB1P82279 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
CRB1P82279 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
CRB1P82279 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC37.06■■■■□ 3.52
CRB1P82279 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
CRB1P82279 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
CRB1P82279 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
CRB1P82279 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
CRB1P82279 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
CRB1P82279 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
CRB1P82279 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC37.04■■■■□ 3.52
CRB1P82279 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC37.04■■■■□ 3.52
CRB1P82279 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms