Protein–RNA interactions for Protein: P80162

CXCL6, C-X-C motif chemokine 6, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL6P80162 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CXCL6P80162 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CXCL6P80162 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CXCL6P80162 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CXCL6P80162 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CXCL6P80162 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CXCL6P80162 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CXCL6P80162 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CXCL6P80162 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CXCL6P80162 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CXCL6P80162 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CXCL6P80162 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CXCL6P80162 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CXCL6P80162 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CXCL6P80162 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CXCL6P80162 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CXCL6P80162 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CXCL6P80162 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CXCL6P80162 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CXCL6P80162 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CXCL6P80162 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CXCL6P80162 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CXCL6P80162 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CXCL6P80162 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CXCL6P80162 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CXCL6P80162 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CXCL6P80162 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CXCL6P80162 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CXCL6P80162 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CXCL6P80162 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CXCL6P80162 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL6P80162 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CXCL6P80162 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CXCL6P80162 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CXCL6P80162 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CXCL6P80162 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CXCL6P80162 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CXCL6P80162 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CXCL6P80162 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CXCL6P80162 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL6P80162 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL6P80162 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL6P80162 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL6P80162 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CXCL6P80162 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CXCL6P80162 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CXCL6P80162 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CXCL6P80162 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CXCL6P80162 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CXCL6P80162 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CXCL6P80162 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CXCL6P80162 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CXCL6P80162 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CXCL6P80162 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CXCL6P80162 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CXCL6P80162 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CXCL6P80162 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CXCL6P80162 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CXCL6P80162 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CXCL6P80162 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CXCL6P80162 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CXCL6P80162 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CXCL6P80162 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CXCL6P80162 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CXCL6P80162 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CXCL6P80162 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CXCL6P80162 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CXCL6P80162 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CXCL6P80162 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CXCL6P80162 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL6P80162 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL6P80162 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL6P80162 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL6P80162 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL6P80162 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL6P80162 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL6P80162 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL6P80162 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CXCL6P80162 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CXCL6P80162 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CXCL6P80162 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CXCL6P80162 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CXCL6P80162 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CXCL6P80162 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL6P80162 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL6P80162 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL6P80162 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL6P80162 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL6P80162 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL6P80162 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL6P80162 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CXCL6P80162 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CXCL6P80162 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CXCL6P80162 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CXCL6P80162 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CXCL6P80162 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CXCL6P80162 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CXCL6P80162 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CXCL6P80162 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CXCL6P80162 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 163.8 ms