Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
IRX1P78414 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
IRX1P78414 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
IRX1P78414 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
IRX1P78414 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
IRX1P78414 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
IRX1P78414 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
IRX1P78414 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
IRX1P78414 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
IRX1P78414 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
IRX1P78414 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
IRX1P78414 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
IRX1P78414 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
IRX1P78414 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
IRX1P78414 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
IRX1P78414 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
IRX1P78414 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
IRX1P78414 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
IRX1P78414 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
IRX1P78414 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
IRX1P78414 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
IRX1P78414 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
IRX1P78414 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
IRX1P78414 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
IRX1P78414 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
IRX1P78414 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
IRX1P78414 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
IRX1P78414 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
IRX1P78414 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IRX1P78414 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IRX1P78414 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IRX1P78414 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
IRX1P78414 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
IRX1P78414 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
IRX1P78414 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
IRX1P78414 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
IRX1P78414 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IRX1P78414 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IRX1P78414 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IRX1P78414 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
IRX1P78414 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
IRX1P78414 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
IRX1P78414 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
IRX1P78414 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
IRX1P78414 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
IRX1P78414 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
IRX1P78414 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
IRX1P78414 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
IRX1P78414 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
IRX1P78414 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
IRX1P78414 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
IRX1P78414 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
IRX1P78414 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
IRX1P78414 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
IRX1P78414 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
IRX1P78414 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
IRX1P78414 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
IRX1P78414 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IRX1P78414 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
IRX1P78414 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
IRX1P78414 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
IRX1P78414 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
IRX1P78414 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
IRX1P78414 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
IRX1P78414 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
IRX1P78414 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
IRX1P78414 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
IRX1P78414 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
IRX1P78414 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
IRX1P78414 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
IRX1P78414 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
IRX1P78414 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
IRX1P78414 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
IRX1P78414 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
IRX1P78414 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
IRX1P78414 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
IRX1P78414 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
IRX1P78414 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
IRX1P78414 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
IRX1P78414 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
IRX1P78414 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
IRX1P78414 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
IRX1P78414 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
IRX1P78414 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
IRX1P78414 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
IRX1P78414 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
IRX1P78414 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
IRX1P78414 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
IRX1P78414 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
IRX1P78414 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
IRX1P78414 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
IRX1P78414 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
IRX1P78414 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
IRX1P78414 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
IRX1P78414 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
IRX1P78414 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
IRX1P78414 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
IRX1P78414 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
IRX1P78414 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
IRX1P78414 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms