Protein–RNA interactions for Protein: P78357

CNTNAP1, Contactin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP1P78357 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CNTNAP1P78357 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CNTNAP1P78357 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CNTNAP1P78357 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CNTNAP1P78357 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
CNTNAP1P78357 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CNTNAP1P78357 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CNTNAP1P78357 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
CNTNAP1P78357 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
CNTNAP1P78357 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CNTNAP1P78357 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CNTNAP1P78357 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
CNTNAP1P78357 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CNTNAP1P78357 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CNTNAP1P78357 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CNTNAP1P78357 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CNTNAP1P78357 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
CNTNAP1P78357 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CNTNAP1P78357 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
CNTNAP1P78357 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CNTNAP1P78357 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CNTNAP1P78357 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CNTNAP1P78357 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CNTNAP1P78357 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
CNTNAP1P78357 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CNTNAP1P78357 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CNTNAP1P78357 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CNTNAP1P78357 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CNTNAP1P78357 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
CNTNAP1P78357 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CNTNAP1P78357 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CNTNAP1P78357 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CNTNAP1P78357 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CNTNAP1P78357 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
CNTNAP1P78357 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
CNTNAP1P78357 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
CNTNAP1P78357 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
CNTNAP1P78357 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
CNTNAP1P78357 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
CNTNAP1P78357 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC33.76■■■■□ 3
CNTNAP1P78357 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CNTNAP1P78357 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CNTNAP1P78357 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
CNTNAP1P78357 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CNTNAP1P78357 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CNTNAP1P78357 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CNTNAP1P78357 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CNTNAP1P78357 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CNTNAP1P78357 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
CNTNAP1P78357 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CNTNAP1P78357 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CNTNAP1P78357 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CNTNAP1P78357 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CNTNAP1P78357 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CNTNAP1P78357 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CNTNAP1P78357 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
CNTNAP1P78357 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CNTNAP1P78357 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CNTNAP1P78357 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CNTNAP1P78357 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CNTNAP1P78357 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CNTNAP1P78357 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CNTNAP1P78357 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CNTNAP1P78357 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CNTNAP1P78357 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
CNTNAP1P78357 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CNTNAP1P78357 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CNTNAP1P78357 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CNTNAP1P78357 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CNTNAP1P78357 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CNTNAP1P78357 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CNTNAP1P78357 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
CNTNAP1P78357 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
CNTNAP1P78357 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CNTNAP1P78357 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CNTNAP1P78357 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
CNTNAP1P78357 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
CNTNAP1P78357 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CNTNAP1P78357 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CNTNAP1P78357 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CNTNAP1P78357 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CNTNAP1P78357 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CNTNAP1P78357 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CNTNAP1P78357 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CNTNAP1P78357 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CNTNAP1P78357 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CNTNAP1P78357 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CNTNAP1P78357 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CNTNAP1P78357 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CNTNAP1P78357 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CNTNAP1P78357 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CNTNAP1P78357 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CNTNAP1P78357 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CNTNAP1P78357 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CNTNAP1P78357 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CNTNAP1P78357 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CNTNAP1P78357 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CNTNAP1P78357 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
CNTNAP1P78357 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CNTNAP1P78357 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms