Protein–RNA interactions for Protein: P68543

UBXN2A, UBX domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN2AP68543 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
UBXN2AP68543 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
UBXN2AP68543 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
UBXN2AP68543 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
UBXN2AP68543 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
UBXN2AP68543 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
UBXN2AP68543 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
UBXN2AP68543 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
UBXN2AP68543 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
UBXN2AP68543 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
UBXN2AP68543 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
UBXN2AP68543 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
UBXN2AP68543 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
UBXN2AP68543 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
UBXN2AP68543 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
UBXN2AP68543 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
UBXN2AP68543 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
UBXN2AP68543 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
UBXN2AP68543 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
UBXN2AP68543 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC32.38■■■□□ 2.77
UBXN2AP68543 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
UBXN2AP68543 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
UBXN2AP68543 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC32.37■■■□□ 2.77
UBXN2AP68543 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
UBXN2AP68543 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
UBXN2AP68543 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
UBXN2AP68543 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
UBXN2AP68543 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
UBXN2AP68543 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
UBXN2AP68543 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
UBXN2AP68543 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
UBXN2AP68543 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
UBXN2AP68543 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
UBXN2AP68543 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
UBXN2AP68543 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
UBXN2AP68543 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
UBXN2AP68543 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
UBXN2AP68543 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
UBXN2AP68543 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
UBXN2AP68543 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
UBXN2AP68543 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
UBXN2AP68543 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
UBXN2AP68543 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
UBXN2AP68543 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
UBXN2AP68543 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
UBXN2AP68543 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
UBXN2AP68543 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
UBXN2AP68543 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
UBXN2AP68543 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
UBXN2AP68543 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
UBXN2AP68543 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
UBXN2AP68543 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
UBXN2AP68543 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
UBXN2AP68543 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
UBXN2AP68543 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
UBXN2AP68543 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
UBXN2AP68543 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
UBXN2AP68543 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
UBXN2AP68543 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
UBXN2AP68543 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
UBXN2AP68543 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
UBXN2AP68543 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
UBXN2AP68543 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
UBXN2AP68543 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
UBXN2AP68543 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
UBXN2AP68543 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
UBXN2AP68543 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
UBXN2AP68543 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
UBXN2AP68543 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
UBXN2AP68543 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
UBXN2AP68543 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
UBXN2AP68543 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC32■■■□□ 2.71
UBXN2AP68543 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
UBXN2AP68543 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
UBXN2AP68543 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
UBXN2AP68543 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
UBXN2AP68543 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
UBXN2AP68543 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
UBXN2AP68543 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
UBXN2AP68543 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
UBXN2AP68543 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
UBXN2AP68543 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
UBXN2AP68543 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
UBXN2AP68543 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
UBXN2AP68543 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
UBXN2AP68543 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
UBXN2AP68543 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
UBXN2AP68543 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
UBXN2AP68543 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
UBXN2AP68543 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
UBXN2AP68543 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
UBXN2AP68543 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
UBXN2AP68543 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
UBXN2AP68543 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
UBXN2AP68543 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
UBXN2AP68543 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
UBXN2AP68543 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
UBXN2AP68543 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
UBXN2AP68543 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
UBXN2AP68543 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms