Protein–RNA interactions for Protein: P62266

RPS23, 40S ribosomal protein S23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS23P62266 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS23P62266 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS23P62266 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPS23P62266 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS23P62266 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS23P62266 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS23P62266 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS23P62266 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPS23P62266 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RPS23P62266 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RPS23P62266 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPS23P62266 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS23P62266 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPS23P62266 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPS23P62266 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPS23P62266 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPS23P62266 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPS23P62266 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPS23P62266 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPS23P62266 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPS23P62266 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPS23P62266 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPS23P62266 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPS23P62266 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPS23P62266 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPS23P62266 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPS23P62266 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPS23P62266 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPS23P62266 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPS23P62266 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPS23P62266 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPS23P62266 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPS23P62266 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPS23P62266 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPS23P62266 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPS23P62266 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RPS23P62266 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPS23P62266 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPS23P62266 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPS23P62266 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPS23P62266 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPS23P62266 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS23P62266 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS23P62266 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS23P62266 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS23P62266 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS23P62266 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS23P62266 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPS23P62266 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPS23P62266 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPS23P62266 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPS23P62266 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPS23P62266 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPS23P62266 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RPS23P62266 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPS23P62266 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPS23P62266 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPS23P62266 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPS23P62266 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPS23P62266 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPS23P62266 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RPS23P62266 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPS23P62266 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPS23P62266 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPS23P62266 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPS23P62266 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPS23P62266 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPS23P62266 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPS23P62266 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPS23P62266 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPS23P62266 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPS23P62266 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS23P62266 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS23P62266 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS23P62266 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS23P62266 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPS23P62266 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RPS23P62266 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS23P62266 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS23P62266 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS23P62266 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS23P62266 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS23P62266 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS23P62266 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPS23P62266 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPS23P62266 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPS23P62266 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS23P62266 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS23P62266 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS23P62266 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS23P62266 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS23P62266 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS23P62266 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS23P62266 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS23P62266 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS23P62266 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS23P62266 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS23P62266 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS23P62266 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS23P62266 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms