Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HERVK_113P61574 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HERVK_113P61574 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
HERVK_113P61574 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HERVK_113P61574 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HERVK_113P61574 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HERVK_113P61574 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HERVK_113P61574 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HERVK_113P61574 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
HERVK_113P61574 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HERVK_113P61574 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HERVK_113P61574 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HERVK_113P61574 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HERVK_113P61574 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HERVK_113P61574 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERVK_113P61574 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HERVK_113P61574 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HERVK_113P61574 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HERVK_113P61574 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HERVK_113P61574 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERVK_113P61574 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERVK_113P61574 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERVK_113P61574 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERVK_113P61574 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERVK_113P61574 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERVK_113P61574 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERVK_113P61574 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERVK_113P61574 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HERVK_113P61574 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HERVK_113P61574 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113P61574 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113P61574 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113P61574 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERVK_113P61574 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERVK_113P61574 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERVK_113P61574 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERVK_113P61574 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERVK_113P61574 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERVK_113P61574 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERVK_113P61574 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERVK_113P61574 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERVK_113P61574 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERVK_113P61574 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HERVK_113P61574 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HERVK_113P61574 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HERVK_113P61574 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HERVK_113P61574 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HERVK_113P61574 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HERVK_113P61574 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HERVK_113P61574 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HERVK_113P61574 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HERVK_113P61574 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HERVK_113P61574 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HERVK_113P61574 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HERVK_113P61574 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HERVK_113P61574 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HERVK_113P61574 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HERVK_113P61574 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HERVK_113P61574 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HERVK_113P61574 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERVK_113P61574 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
HERVK_113P61574 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERVK_113P61574 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
HERVK_113P61574 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERVK_113P61574 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERVK_113P61574 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERVK_113P61574 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERVK_113P61574 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERVK_113P61574 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERVK_113P61574 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HERVK_113P61574 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HERVK_113P61574 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERVK_113P61574 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERVK_113P61574 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERVK_113P61574 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERVK_113P61574 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERVK_113P61574 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERVK_113P61574 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERVK_113P61574 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERVK_113P61574 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HERVK_113P61574 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HERVK_113P61574 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HERVK_113P61574 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HERVK_113P61574 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HERVK_113P61574 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERVK_113P61574 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERVK_113P61574 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERVK_113P61574 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERVK_113P61574 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERVK_113P61574 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERVK_113P61574 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERVK_113P61574 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERVK_113P61574 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERVK_113P61574 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERVK_113P61574 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERVK_113P61574 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERVK_113P61574 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HERVK_113P61574 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HERVK_113P61574 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HERVK_113P61574 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms