Protein–RNA interactions for Protein: P59190

RAB15, Ras-related protein Rab-15, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB15P59190 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAB15P59190 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAB15P59190 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAB15P59190 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAB15P59190 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
RAB15P59190 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAB15P59190 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAB15P59190 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RAB15P59190 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RAB15P59190 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RAB15P59190 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAB15P59190 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAB15P59190 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAB15P59190 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAB15P59190 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAB15P59190 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAB15P59190 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
RAB15P59190 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAB15P59190 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAB15P59190 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAB15P59190 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAB15P59190 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAB15P59190 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAB15P59190 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAB15P59190 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RAB15P59190 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RAB15P59190 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
RAB15P59190 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAB15P59190 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAB15P59190 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAB15P59190 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAB15P59190 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAB15P59190 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAB15P59190 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAB15P59190 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAB15P59190 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAB15P59190 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAB15P59190 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAB15P59190 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAB15P59190 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB15P59190 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RAB15P59190 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAB15P59190 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAB15P59190 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RAB15P59190 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RAB15P59190 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RAB15P59190 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RAB15P59190 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RAB15P59190 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAB15P59190 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAB15P59190 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RAB15P59190 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAB15P59190 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAB15P59190 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAB15P59190 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAB15P59190 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAB15P59190 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
RAB15P59190 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAB15P59190 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAB15P59190 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAB15P59190 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAB15P59190 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAB15P59190 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAB15P59190 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAB15P59190 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAB15P59190 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAB15P59190 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RAB15P59190 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RAB15P59190 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAB15P59190 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAB15P59190 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAB15P59190 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAB15P59190 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
RAB15P59190 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAB15P59190 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAB15P59190 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAB15P59190 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
RAB15P59190 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAB15P59190 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RAB15P59190 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAB15P59190 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAB15P59190 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAB15P59190 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAB15P59190 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAB15P59190 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAB15P59190 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAB15P59190 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAB15P59190 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAB15P59190 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAB15P59190 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAB15P59190 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAB15P59190 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAB15P59190 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAB15P59190 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
RAB15P59190 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAB15P59190 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAB15P59190 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAB15P59190 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAB15P59190 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAB15P59190 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms