Protein–RNA interactions for Protein: P53041

PPP5C, Serine/threonine-protein phosphatase 5, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP5CP53041 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP5CP53041 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP5CP53041 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPP5CP53041 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPP5CP53041 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPP5CP53041 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP5CP53041 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP5CP53041 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP5CP53041 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPP5CP53041 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPP5CP53041 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPP5CP53041 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPP5CP53041 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPP5CP53041 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPP5CP53041 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPP5CP53041 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPP5CP53041 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPP5CP53041 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPP5CP53041 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPP5CP53041 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPP5CP53041 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPP5CP53041 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPP5CP53041 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPP5CP53041 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPP5CP53041 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPP5CP53041 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPP5CP53041 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPP5CP53041 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP5CP53041 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP5CP53041 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPP5CP53041 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPP5CP53041 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPP5CP53041 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPP5CP53041 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPP5CP53041 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPP5CP53041 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPP5CP53041 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPP5CP53041 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPP5CP53041 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPP5CP53041 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPP5CP53041 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPP5CP53041 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPP5CP53041 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPP5CP53041 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPP5CP53041 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPP5CP53041 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPP5CP53041 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPP5CP53041 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP5CP53041 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP5CP53041 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PPP5CP53041 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PPP5CP53041 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPP5CP53041 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPP5CP53041 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP5CP53041 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP5CP53041 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP5CP53041 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPP5CP53041 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPP5CP53041 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPP5CP53041 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPP5CP53041 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP5CP53041 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPP5CP53041 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPP5CP53041 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPP5CP53041 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPP5CP53041 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPP5CP53041 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPP5CP53041 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPP5CP53041 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP5CP53041 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP5CP53041 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP5CP53041 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP5CP53041 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP5CP53041 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP5CP53041 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP5CP53041 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP5CP53041 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP5CP53041 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP5CP53041 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP5CP53041 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP5CP53041 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP5CP53041 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP5CP53041 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP5CP53041 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP5CP53041 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PPP5CP53041 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PPP5CP53041 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP5CP53041 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP5CP53041 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP5CP53041 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP5CP53041 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP5CP53041 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP5CP53041 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP5CP53041 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP5CP53041 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP5CP53041 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP5CP53041 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPP5CP53041 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPP5CP53041 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PPP5CP53041 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms