Protein–RNA interactions for Protein: P51160

PDE6C, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6CP51160 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PDE6CP51160 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PDE6CP51160 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PDE6CP51160 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PDE6CP51160 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PDE6CP51160 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PDE6CP51160 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PDE6CP51160 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PDE6CP51160 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PDE6CP51160 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PDE6CP51160 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PDE6CP51160 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PDE6CP51160 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PDE6CP51160 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PDE6CP51160 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PDE6CP51160 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PDE6CP51160 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PDE6CP51160 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PDE6CP51160 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PDE6CP51160 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PDE6CP51160 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PDE6CP51160 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PDE6CP51160 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PDE6CP51160 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PDE6CP51160 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PDE6CP51160 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PDE6CP51160 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PDE6CP51160 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PDE6CP51160 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PDE6CP51160 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PDE6CP51160 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
PDE6CP51160 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PDE6CP51160 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PDE6CP51160 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PDE6CP51160 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PDE6CP51160 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PDE6CP51160 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PDE6CP51160 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PDE6CP51160 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PDE6CP51160 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PDE6CP51160 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PDE6CP51160 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PDE6CP51160 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PDE6CP51160 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PDE6CP51160 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PDE6CP51160 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PDE6CP51160 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PDE6CP51160 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PDE6CP51160 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PDE6CP51160 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PDE6CP51160 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PDE6CP51160 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PDE6CP51160 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PDE6CP51160 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PDE6CP51160 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PDE6CP51160 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PDE6CP51160 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PDE6CP51160 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PDE6CP51160 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PDE6CP51160 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
PDE6CP51160 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
PDE6CP51160 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PDE6CP51160 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PDE6CP51160 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PDE6CP51160 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PDE6CP51160 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PDE6CP51160 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PDE6CP51160 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PDE6CP51160 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PDE6CP51160 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PDE6CP51160 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PDE6CP51160 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PDE6CP51160 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PDE6CP51160 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
PDE6CP51160 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PDE6CP51160 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PDE6CP51160 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PDE6CP51160 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PDE6CP51160 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
PDE6CP51160 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PDE6CP51160 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PDE6CP51160 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PDE6CP51160 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PDE6CP51160 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PDE6CP51160 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PDE6CP51160 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PDE6CP51160 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PDE6CP51160 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PDE6CP51160 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PDE6CP51160 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PDE6CP51160 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PDE6CP51160 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
PDE6CP51160 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PDE6CP51160 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PDE6CP51160 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PDE6CP51160 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PDE6CP51160 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PDE6CP51160 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PDE6CP51160 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PDE6CP51160 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms