Protein–RNA interactions for Protein: P49639

HOXA1, Homeobox protein Hox-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA1P49639 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA1P49639 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA1P49639 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA1P49639 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA1P49639 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA1P49639 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA1P49639 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA1P49639 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA1P49639 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA1P49639 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA1P49639 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA1P49639 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA1P49639 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA1P49639 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA1P49639 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA1P49639 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXA1P49639 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXA1P49639 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA1P49639 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA1P49639 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA1P49639 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA1P49639 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA1P49639 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HOXA1P49639 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXA1P49639 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA1P49639 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA1P49639 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA1P49639 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA1P49639 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA1P49639 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA1P49639 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA1P49639 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA1P49639 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA1P49639 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HOXA1P49639 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HOXA1P49639 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA1P49639 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA1P49639 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA1P49639 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXA1P49639 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA1P49639 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA1P49639 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA1P49639 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA1P49639 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA1P49639 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA1P49639 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXA1P49639 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA1P49639 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA1P49639 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA1P49639 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA1P49639 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA1P49639 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA1P49639 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA1P49639 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA1P49639 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA1P49639 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA1P49639 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA1P49639 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA1P49639 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA1P49639 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA1P49639 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA1P49639 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA1P49639 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA1P49639 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA1P49639 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA1P49639 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA1P49639 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA1P49639 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA1P49639 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA1P49639 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA1P49639 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXA1P49639 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA1P49639 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA1P49639 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA1P49639 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA1P49639 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA1P49639 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA1P49639 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA1P49639 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA1P49639 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA1P49639 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA1P49639 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA1P49639 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA1P49639 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA1P49639 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA1P49639 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA1P49639 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA1P49639 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA1P49639 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA1P49639 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA1P49639 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA1P49639 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA1P49639 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA1P49639 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA1P49639 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA1P49639 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA1P49639 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA1P49639 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA1P49639 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA1P49639 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms