Protein–RNA interactions for Protein: P48552

NRIP1, Nuclear receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP1P48552 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NRIP1P48552 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NRIP1P48552 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NRIP1P48552 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NRIP1P48552 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NRIP1P48552 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NRIP1P48552 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NRIP1P48552 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NRIP1P48552 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NRIP1P48552 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NRIP1P48552 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
NRIP1P48552 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NRIP1P48552 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NRIP1P48552 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
NRIP1P48552 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NRIP1P48552 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NRIP1P48552 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NRIP1P48552 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NRIP1P48552 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NRIP1P48552 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NRIP1P48552 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NRIP1P48552 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NRIP1P48552 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NRIP1P48552 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
NRIP1P48552 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NRIP1P48552 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NRIP1P48552 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NRIP1P48552 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NRIP1P48552 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
NRIP1P48552 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NRIP1P48552 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
NRIP1P48552 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NRIP1P48552 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NRIP1P48552 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NRIP1P48552 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NRIP1P48552 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NRIP1P48552 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NRIP1P48552 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NRIP1P48552 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NRIP1P48552 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
NRIP1P48552 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NRIP1P48552 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NRIP1P48552 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NRIP1P48552 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NRIP1P48552 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
NRIP1P48552 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NRIP1P48552 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NRIP1P48552 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NRIP1P48552 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NRIP1P48552 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
NRIP1P48552 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NRIP1P48552 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NRIP1P48552 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NRIP1P48552 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
NRIP1P48552 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NRIP1P48552 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NRIP1P48552 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NRIP1P48552 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NRIP1P48552 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NRIP1P48552 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NRIP1P48552 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
NRIP1P48552 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
NRIP1P48552 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NRIP1P48552 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
NRIP1P48552 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NRIP1P48552 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NRIP1P48552 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NRIP1P48552 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NRIP1P48552 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
NRIP1P48552 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NRIP1P48552 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NRIP1P48552 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NRIP1P48552 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NRIP1P48552 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NRIP1P48552 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NRIP1P48552 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NRIP1P48552 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NRIP1P48552 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NRIP1P48552 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NRIP1P48552 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NRIP1P48552 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NRIP1P48552 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
NRIP1P48552 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NRIP1P48552 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NRIP1P48552 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NRIP1P48552 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NRIP1P48552 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NRIP1P48552 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NRIP1P48552 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NRIP1P48552 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NRIP1P48552 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NRIP1P48552 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NRIP1P48552 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
NRIP1P48552 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NRIP1P48552 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NRIP1P48552 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NRIP1P48552 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NRIP1P48552 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NRIP1P48552 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NRIP1P48552 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms