Protein–RNA interactions for Protein: P47710

CSN1S1, Alpha-S1-casein, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN1S1P47710 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSN1S1P47710 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CSN1S1P47710 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CSN1S1P47710 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CSN1S1P47710 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSN1S1P47710 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSN1S1P47710 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSN1S1P47710 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSN1S1P47710 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSN1S1P47710 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSN1S1P47710 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSN1S1P47710 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSN1S1P47710 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSN1S1P47710 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSN1S1P47710 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSN1S1P47710 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSN1S1P47710 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSN1S1P47710 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSN1S1P47710 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSN1S1P47710 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSN1S1P47710 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSN1S1P47710 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSN1S1P47710 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSN1S1P47710 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSN1S1P47710 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSN1S1P47710 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSN1S1P47710 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSN1S1P47710 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSN1S1P47710 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSN1S1P47710 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSN1S1P47710 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSN1S1P47710 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSN1S1P47710 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSN1S1P47710 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSN1S1P47710 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSN1S1P47710 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSN1S1P47710 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSN1S1P47710 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSN1S1P47710 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSN1S1P47710 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSN1S1P47710 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CSN1S1P47710 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CSN1S1P47710 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CSN1S1P47710 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CSN1S1P47710 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CSN1S1P47710 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CSN1S1P47710 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CSN1S1P47710 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CSN1S1P47710 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CSN1S1P47710 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CSN1S1P47710 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CSN1S1P47710 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CSN1S1P47710 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CSN1S1P47710 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CSN1S1P47710 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSN1S1P47710 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSN1S1P47710 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSN1S1P47710 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSN1S1P47710 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSN1S1P47710 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSN1S1P47710 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CSN1S1P47710 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CSN1S1P47710 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSN1S1P47710 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSN1S1P47710 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSN1S1P47710 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSN1S1P47710 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CSN1S1P47710 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CSN1S1P47710 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CSN1S1P47710 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CSN1S1P47710 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSN1S1P47710 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CSN1S1P47710 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CSN1S1P47710 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CSN1S1P47710 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CSN1S1P47710 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CSN1S1P47710 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CSN1S1P47710 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CSN1S1P47710 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CSN1S1P47710 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CSN1S1P47710 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CSN1S1P47710 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CSN1S1P47710 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CSN1S1P47710 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CSN1S1P47710 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CSN1S1P47710 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CSN1S1P47710 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CSN1S1P47710 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CSN1S1P47710 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CSN1S1P47710 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CSN1S1P47710 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CSN1S1P47710 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CSN1S1P47710 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CSN1S1P47710 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CSN1S1P47710 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CSN1S1P47710 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CSN1S1P47710 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CSN1S1P47710 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CSN1S1P47710 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CSN1S1P47710 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms