Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RPA3P35244 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RPA3P35244 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RPA3P35244 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RPA3P35244 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RPA3P35244 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RPA3P35244 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RPA3P35244 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RPA3P35244 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RPA3P35244 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPA3P35244 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPA3P35244 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RPA3P35244 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RPA3P35244 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RPA3P35244 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RPA3P35244 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPA3P35244 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPA3P35244 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPA3P35244 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPA3P35244 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPA3P35244 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPA3P35244 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPA3P35244 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RPA3P35244 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RPA3P35244 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPA3P35244 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RPA3P35244 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPA3P35244 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPA3P35244 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RPA3P35244 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPA3P35244 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPA3P35244 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPA3P35244 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPA3P35244 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPA3P35244 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RPA3P35244 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPA3P35244 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RPA3P35244 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RPA3P35244 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
RPA3P35244 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RPA3P35244 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RPA3P35244 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RPA3P35244 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RPA3P35244 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RPA3P35244 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RPA3P35244 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RPA3P35244 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RPA3P35244 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RPA3P35244 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RPA3P35244 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RPA3P35244 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RPA3P35244 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RPA3P35244 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RPA3P35244 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RPA3P35244 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
RPA3P35244 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RPA3P35244 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RPA3P35244 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RPA3P35244 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RPA3P35244 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RPA3P35244 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RPA3P35244 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RPA3P35244 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RPA3P35244 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
RPA3P35244 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RPA3P35244 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RPA3P35244 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RPA3P35244 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPA3P35244 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RPA3P35244 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RPA3P35244 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RPA3P35244 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RPA3P35244 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RPA3P35244 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RPA3P35244 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RPA3P35244 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RPA3P35244 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RPA3P35244 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RPA3P35244 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RPA3P35244 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RPA3P35244 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RPA3P35244 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RPA3P35244 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.53■■■□□ 2
RPA3P35244 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RPA3P35244 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RPA3P35244 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RPA3P35244 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RPA3P35244 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
RPA3P35244 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RPA3P35244 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RPA3P35244 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RPA3P35244 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RPA3P35244 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RPA3P35244 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RPA3P35244 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RPA3P35244 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RPA3P35244 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RPA3P35244 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RPA3P35244 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RPA3P35244 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms