Protein–RNA interactions for Protein: P32456

GBP2, Guanylate-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP2P32456 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
GBP2P32456 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GBP2P32456 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
GBP2P32456 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GBP2P32456 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GBP2P32456 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
GBP2P32456 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GBP2P32456 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
GBP2P32456 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GBP2P32456 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GBP2P32456 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GBP2P32456 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GBP2P32456 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GBP2P32456 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GBP2P32456 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
GBP2P32456 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GBP2P32456 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GBP2P32456 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
GBP2P32456 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GBP2P32456 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GBP2P32456 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GBP2P32456 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GBP2P32456 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GBP2P32456 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GBP2P32456 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
GBP2P32456 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GBP2P32456 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GBP2P32456 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GBP2P32456 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GBP2P32456 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GBP2P32456 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GBP2P32456 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GBP2P32456 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GBP2P32456 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GBP2P32456 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GBP2P32456 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GBP2P32456 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GBP2P32456 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
GBP2P32456 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
GBP2P32456 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
GBP2P32456 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
GBP2P32456 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GBP2P32456 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GBP2P32456 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GBP2P32456 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
GBP2P32456 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GBP2P32456 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
GBP2P32456 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GBP2P32456 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GBP2P32456 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GBP2P32456 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GBP2P32456 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GBP2P32456 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GBP2P32456 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GBP2P32456 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
GBP2P32456 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GBP2P32456 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GBP2P32456 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GBP2P32456 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GBP2P32456 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GBP2P32456 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GBP2P32456 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GBP2P32456 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GBP2P32456 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GBP2P32456 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GBP2P32456 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GBP2P32456 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GBP2P32456 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GBP2P32456 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GBP2P32456 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GBP2P32456 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GBP2P32456 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GBP2P32456 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GBP2P32456 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GBP2P32456 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GBP2P32456 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GBP2P32456 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GBP2P32456 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GBP2P32456 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GBP2P32456 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GBP2P32456 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
GBP2P32456 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
GBP2P32456 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GBP2P32456 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
GBP2P32456 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GBP2P32456 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GBP2P32456 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GBP2P32456 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GBP2P32456 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GBP2P32456 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GBP2P32456 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
GBP2P32456 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GBP2P32456 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
GBP2P32456 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GBP2P32456 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GBP2P32456 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GBP2P32456 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GBP2P32456 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GBP2P32456 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GBP2P32456 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms