Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC36.51■■■■□ 3.44
HMGB2P26583 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
HMGB2P26583 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
HMGB2P26583 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
HMGB2P26583 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
HMGB2P26583 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
HMGB2P26583 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
HMGB2P26583 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
HMGB2P26583 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
HMGB2P26583 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
HMGB2P26583 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
HMGB2P26583 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
HMGB2P26583 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
HMGB2P26583 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
HMGB2P26583 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
HMGB2P26583 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
HMGB2P26583 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
HMGB2P26583 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
HMGB2P26583 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
HMGB2P26583 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
HMGB2P26583 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
HMGB2P26583 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
HMGB2P26583 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
HMGB2P26583 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
HMGB2P26583 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
HMGB2P26583 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
HMGB2P26583 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
HMGB2P26583 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
HMGB2P26583 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
HMGB2P26583 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
HMGB2P26583 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
HMGB2P26583 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
HMGB2P26583 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
HMGB2P26583 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
HMGB2P26583 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
HMGB2P26583 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
HMGB2P26583 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
HMGB2P26583 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
HMGB2P26583 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
HMGB2P26583 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
HMGB2P26583 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
HMGB2P26583 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
HMGB2P26583 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
HMGB2P26583 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
HMGB2P26583 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
HMGB2P26583 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
HMGB2P26583 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC36■■■■□ 3.35
HMGB2P26583 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
HMGB2P26583 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
HMGB2P26583 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
HMGB2P26583 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
HMGB2P26583 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC35.96■■■■□ 3.35
HMGB2P26583 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
HMGB2P26583 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
HMGB2P26583 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
HMGB2P26583 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
HMGB2P26583 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
HMGB2P26583 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
HMGB2P26583 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
HMGB2P26583 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
HMGB2P26583 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
HMGB2P26583 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
HMGB2P26583 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
HMGB2P26583 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
HMGB2P26583 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
HMGB2P26583 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
HMGB2P26583 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
HMGB2P26583 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
HMGB2P26583 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
HMGB2P26583 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
HMGB2P26583 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
HMGB2P26583 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
HMGB2P26583 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
HMGB2P26583 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
HMGB2P26583 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
HMGB2P26583 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
HMGB2P26583 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
HMGB2P26583 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
HMGB2P26583 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
HMGB2P26583 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC35.7■■■■□ 3.31
HMGB2P26583 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
HMGB2P26583 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
HMGB2P26583 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
HMGB2P26583 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
HMGB2P26583 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
HMGB2P26583 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
HMGB2P26583 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
HMGB2P26583 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
HMGB2P26583 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC35.56■■■■□ 3.28
HMGB2P26583 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
HMGB2P26583 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
HMGB2P26583 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
HMGB2P26583 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
HMGB2P26583 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
HMGB2P26583 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
HMGB2P26583 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
HMGB2P26583 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
HMGB2P26583 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
HMGB2P26583 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
HMGB2P26583 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms